More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1462 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 261 aa  521  1e-147  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  40 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  36.33 
 
 		 256 aa  139  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  38.11 
 
 		 262 aa  138  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  35.22 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  34.67 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  37.67 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  32.35 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  36 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1621  IclR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706324  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  33.97 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1646  IclR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1594  IclR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  35.12 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 272 aa  126  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  36.29 
 
 		 276 aa  125  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0686  regulatory protein, IclR  35.07 
 
 		 266 aa  125  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  32.65 
 
 		 265 aa  125  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 273 aa  125  6e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  34.78 
 
 		 265 aa  125  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  36.69 
 
 		 281 aa  125  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0596  regulatory protein, IclR  33.05 
 
 		 293 aa  125  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.691457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0340  IclR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  31.22 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  31.22 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  31.22 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  31.22 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  31.22 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  31.22 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  31.22 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  31.22 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  36.87 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  35.5 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 282 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0462  regulatory proteins, IclR  33.05 
 
 		 268 aa  122  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 251 aa  122  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 269 aa  122  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  30.77 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  30.77 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  30.77 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  30.77 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  30.77 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  38.46 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  34.22 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 260 aa  119  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 283 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  29.86 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  36.49 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  36.84 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  37.75 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  38.2 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  34.4 
 
 		 259 aa  115  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  29.28 
 
 		 273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  31.95 
 
 		 257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  32.33 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  29.41 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  27.78 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  29.41 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  29.41 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  33.91 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  30.26 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  29.41 
 
 		 277 aa  111  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  32.5 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  31.22 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  33.48 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  30.37 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  34.3 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  33.94 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  33.93 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  33.78 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  32.58 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 259 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  32.13 
 
 		 255 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  30.12 
 
 		 267 aa  108  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 260 aa  108  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  29.44 
 
 		 280 aa  108  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  28.93 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  29.41 
 
 		 277 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  27.64 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  33.48 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 275 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  28.85 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>