More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2309 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 253 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  41.53 
 
 		 255 aa  222  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  44.67 
 
 		 265 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  42.04 
 
 		 275 aa  205  5e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  38 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 275 aa  160  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  35.77 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 260 aa  155  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  35.39 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  34.39 
 
 		 265 aa  152  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 260 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 260 aa  149  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  34.26 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 257 aa  149  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  31.28 
 
 		 257 aa  149  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  34.66 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  32.92 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 261 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  32.68 
 
 		 280 aa  145  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  33.92 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  32.51 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 265 aa  143  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  36.08 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  34.71 
 
 		 247 aa  141  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  31.85 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 277 aa  139  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0596  regulatory protein, IclR  35.45 
 
 		 293 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.691457  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.23 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  31.47 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  31.23 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  31.23 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  31.23 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  31.23 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  31.67 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  31.23 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  31.84 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  32.94 
 
 		 263 aa  135  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  30.04 
 
 		 252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  31.3 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  31.08 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  30.83 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  34.65 
 
 		 257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  32.52 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  30.83 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  30.83 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 284 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  30.83 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  30.83 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  31.25 
 
 		 251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  30.83 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  30.43 
 
 		 263 aa  132  6.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  30.45 
 
 		 252 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  32.53 
 
 		 279 aa  131  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  32.89 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0462  regulatory proteins, IclR  34.74 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 267 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  33.46 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1621  IclR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 297 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706324  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  31.47 
 
 		 254 aa  129  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1646  IclR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 297 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1594  IclR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 297 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0686  regulatory protein, IclR  33.98 
 
 		 266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4369  IclR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  32 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  31.93 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  30.71 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  30.04 
 
 		 248 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  30.86 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  30.86 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  33.2 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  30.86 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  30.17 
 
 		 276 aa  125  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  34.15 
 
 		 255 aa  125  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 291 aa  125  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  30 
 
 		 279 aa  125  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  30.45 
 
 		 249 aa  125  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  30.65 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  31.97 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  29.63 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 550 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  29.25 
 
 		 263 aa  123  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 269 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  29.25 
 
 		 263 aa  123  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  30.54 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>