More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2380 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 291 aa  587  1e-167  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2778  IclR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 253 aa  179  5.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0655324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  39.43 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2381  IclR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  41.46 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2810  IclR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.162852  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  37.88 
 
 		 267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  38.89 
 
 		 265 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  35.22 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  39.92 
 
 		 259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  34.82 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  34.41 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  34.01 
 
 		 252 aa  136  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  36.05 
 
 		 275 aa  133  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 268 aa  132  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  36.75 
 
 		 308 aa  132  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  37.99 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  32.02 
 
 		 257 aa  132  6.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  34.41 
 
 		 261 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  31.08 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  33.06 
 
 		 260 aa  126  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  36.6 
 
 		 253 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  32.77 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 267 aa  123  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  32.02 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  33.49 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 		 256 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 250 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  28.4 
 
 		 267 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  30.86 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  35.08 
 
 		 262 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  34.39 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  30.67 
 
 		 250 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  36.44 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0190  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 241 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.49367  normal  0.390724 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  31.09 
 
 		 250 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  28.11 
 
 		 251 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  32.94 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  34.68 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  33.86 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  35.6 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 254 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  29.83 
 
 		 250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2063  transcriptional regulator IclR  31.95 
 
 		 255 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0428372  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  30.25 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2736  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  31.98 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3829  transcriptional regulator, IclR family  34.18 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  31.98 
 
 		 260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  33.86 
 
 		 277 aa  112  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  37.69 
 
 		 253 aa  112  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 257 aa  112  8.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  32.74 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  28.69 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  36.06 
 
 		 248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  31.72 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1796  IclR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 246 aa  109  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 267 aa  109  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  31.45 
 
 		 266 aa  108  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  31.05 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2259  IclR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.0000000211035 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  34.98 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  33.91 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  33.91 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  35.04 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  33.91 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  33.91 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  33.91 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  33.91 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  31.05 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  33.91 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  33.91 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 260 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  34.53 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 269 aa  106  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>