More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2875 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
250 aa  510  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  93.6 
 
 
250 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  94 
 
 
250 aa  478  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  92.8 
 
 
250 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  92.4 
 
 
250 aa  474  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  92.8 
 
 
250 aa  474  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  92.4 
 
 
250 aa  474  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  92.8 
 
 
250 aa  476  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  92.77 
 
 
250 aa  473  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  92 
 
 
250 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2063  transcriptional regulator IclR  77.42 
 
 
255 aa  385  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0428372  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  47.97 
 
 
249 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  32.92 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  32.65 
 
 
265 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
268 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  29.6 
 
 
252 aa  135  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  29.27 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  28.17 
 
 
252 aa  133  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  28.57 
 
 
252 aa  133  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 
251 aa  133  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  31.58 
 
 
257 aa  131  7.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.05 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28.86 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  29.1 
 
 
246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  28.31 
 
 
255 aa  124  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  32.1 
 
 
266 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
273 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.28 
 
 
280 aa  122  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  31.4 
 
 
254 aa  122  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  32.46 
 
 
265 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  29.05 
 
 
277 aa  122  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  28.74 
 
 
256 aa  121  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  30.09 
 
 
242 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  28.69 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  30.29 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.69 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  33.84 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  28.69 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  28.69 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  28.69 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  28.69 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  28.69 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  29.27 
 
 
258 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4689  transcriptional regulator, IclR family  26.78 
 
 
254 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  29.1 
 
 
263 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  28.69 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  28.05 
 
 
257 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  26.25 
 
 
295 aa  118  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  28.28 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  28.28 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  28.28 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  28.28 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  28.28 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  30.25 
 
 
253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
263 aa  115  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
261 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  31.02 
 
 
269 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1946  transcriptional regulator, IclR family  31.03 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  26.45 
 
 
283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1776  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  27.87 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  26.91 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  30.2 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0134  IclR family transcriptional regulator  29.54 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272177  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  32.11 
 
 
256 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  32.11 
 
 
271 aa  113  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
269 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  32.11 
 
 
256 aa  113  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
269 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
268 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
269 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
269 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  32.11 
 
 
271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  32.11 
 
 
271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  32.11 
 
 
271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1795  IclR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0248874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  32.11 
 
 
271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  32.11 
 
 
271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>