More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6599 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 273 aa  531  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  54.94 
 
 		 283 aa  251  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  50.56 
 
 		 269 aa  249  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  49.79 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  38.43 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  42.4 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  37.01 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 267 aa  149  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  38.31 
 
 		 277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  36.84 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  35.32 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  34.92 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  31.87 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  32.67 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  35.08 
 
 		 261 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  31.87 
 
 		 260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 260 aa  135  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 268 aa  136  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  34.8 
 
 		 255 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4689  transcriptional regulator, IclR family  36.11 
 
 		 254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  31.47 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  32.66 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  35.74 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  38.06 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  32.93 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  30.59 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  40.64 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  35.27 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  33.46 
 
 		 277 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 261 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3974  transcriptional regulator, IclR family  34.63 
 
 		 266 aa  125  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.482822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  29.44 
 
 		 246 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 246 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  31.78 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  38.7 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  32.31 
 
 		 280 aa  122  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 269 aa  123  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  33.6 
 
 		 257 aa  123  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  30.2 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  31.85 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  30.8 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  37.9 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3729  IclR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 268 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  31.87 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  34.54 
 
 		 268 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.8 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  29.8 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  29.8 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  29.8 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  29.8 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  30.28 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  29.8 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  31.23 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  28.63 
 
 		 250 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  29.8 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  30.83 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  28.74 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  34.63 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  32.54 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  30.24 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  36.03 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  31.72 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  28.81 
 
 		 250 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  29.88 
 
 		 295 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2285  transcriptional regulator, IclR family  31.45 
 
 		 259 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  34.54 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 250 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  29.41 
 
 		 263 aa  115  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  30.8 
 
 		 253 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 250 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 258 aa  115  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  27.64 
 
 		 250 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 261 aa  115  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  27.98 
 
 		 250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  30.47 
 
 		 271 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>