More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3974 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3974  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 266 aa  528  1e-149  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.482822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  34.63 
 
 		 273 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  29.41 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  26.67 
 
 		 255 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 250 aa  99.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 261 aa  98.6  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  27.6 
 
 		 258 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4521  IclR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.948737 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3350  transcriptional regulator IclR  27.27 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1646  IclR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1621  IclR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706324  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1594  IclR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 258 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 264 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  25.97 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0462  regulatory proteins, IclR  28.52 
 
 		 268 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  26.24 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 257 aa  93.2  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 250 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  24.91 
 
 		 260 aa  92.8  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 267 aa  92.8  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0686  regulatory protein, IclR  31.16 
 
 		 266 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  25 
 
 		 254 aa  92.8  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  25.4 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0596  regulatory protein, IclR  28.19 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.691457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 262 aa  92  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  25.19 
 
 		 280 aa  91.3  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 268 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  24.8 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  26.95 
 
 		 294 aa  89.7  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  29.27 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  27.88 
 
 		 308 aa  89.7  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 260 aa  89.4  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  28.29 
 
 		 273 aa  89.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  25.71 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  30.33 
 
 		 275 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  20.73 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  28 
 
 		 267 aa  88.6  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  30.33 
 
 		 275 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  26.94 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  23.2 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  25.94 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 267 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13880  transcriptional regulatory protein, IclR family  26 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176969  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  23.2 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 284 aa  86.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  25.59 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4215  transcriptional regulator, IclR family  26.61 
 
 		 258 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0022938  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 249 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 249 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 273 aa  86.3  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  24.12 
 
 		 274 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  24.12 
 
 		 274 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  24.12 
 
 		 274 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  24.12 
 
 		 274 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  24.12 
 
 		 274 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  24.12 
 
 		 274 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  24.12 
 
 		 274 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  24.12 
 
 		 274 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4375  transcriptional regulator, IclR family  25.83 
 
 		 250 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 260 aa  85.9  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 272 aa  85.5  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 283 aa  85.5  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  25.43 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  23.9 
 
 		 249 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2670  transcriptional regulator, IclR family  19.83 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5250  IclR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  23.9 
 
 		 249 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  27.06 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  29.84 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  24.15 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  26.59 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  30.89 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  25.68 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  31.27 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  30.12 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6262  IclR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  24.81 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  24.81 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  24.81 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  23.02 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  22.8 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0800  transcriptional regulator  28.63 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2705  regulatory proteins, IclR  28.09 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  23.08 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>