More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5250 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5250  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 254 aa  496  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0203  IclR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 304 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.670577 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7131  IclR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 280 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0314  transcriptional regulator IclR-like protein  36.84 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0713  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 276 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152863 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  36.09 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  33.74 
 
 		 259 aa  106  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1941  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000383079  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  28.8 
 
 		 275 aa  99.8  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0978  IclR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 292 aa  99.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0639197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  27.93 
 
 		 254 aa  99.4  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.36 
 
 		 280 aa  99.4  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0194  transcriptional regulator, IclR family  30.42 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0903072  decreased coverage  0.000072825 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  30.83 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 254 aa  95.5  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0162  transcriptional regulator, IclR family  33.49 
 
 		 257 aa  95.5  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  27.98 
 
 		 250 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 		 308 aa  93.2  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 250 aa  92.8  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  31.05 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  27.57 
 
 		 250 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 250 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  32.02 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  26.02 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  26.42 
 
 		 280 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  26.42 
 
 		 280 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  26.42 
 
 		 280 aa  90.1  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 262 aa  89.7  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  29.9 
 
 		 264 aa  89.4  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  27.16 
 
 		 250 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 258 aa  89.4  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 250 aa  89  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 250 aa  89  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  27.15 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  27.15 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  27.15 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  27.15 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  26.75 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  27.15 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  27.15 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  27.15 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  27.15 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  32.96 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  26.83 
 
 		 275 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  26.47 
 
 		 261 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  26.24 
 
 		 276 aa  86.3  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2586  IclR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 325 aa  86.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.556667  normal  0.947412 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  27.71 
 
 		 291 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  27.71 
 
 		 291 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 267 aa  85.9  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5080  transcriptional regulator, IclR family  32.62 
 
 		 249 aa  85.5  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 291 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  29.25 
 
 		 265 aa  85.1  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  25.79 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3974  transcriptional regulator, IclR family  29.27 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.482822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  31.53 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  26.24 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  30.49 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1062  IclR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  23.02 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  26.1 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  26.61 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  33.16 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  25.79 
 
 		 274 aa  82  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  25.79 
 
 		 274 aa  82  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 272 aa  82  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  25.79 
 
 		 274 aa  82  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  25.79 
 
 		 274 aa  82  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  25.79 
 
 		 274 aa  82  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  26.42 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  26.1 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3350  transcriptional regulator IclR  26.58 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  28.74 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  27.15 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3497  IclR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  30.99 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2285  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2670  transcriptional regulator, IclR family  24.31 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  28.46 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13880  transcriptional regulatory protein, IclR family  24.78 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176969  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4517  regulatory protein, IclR  30.13 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530625  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4394  IclR family transcriptional regulator family  33.17 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  27.02 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  28.9 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  29.86 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>