More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7131 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7131  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 280 aa  559  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0203  IclR family transcriptional regulator  70.63 
 
 		 304 aa  381  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.670577 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5250  IclR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 264 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0713  IclR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 276 aa  136  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152863 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0194  transcriptional regulator, IclR family  37.1 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0903072  decreased coverage  0.000072825 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1941  IclR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 280 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000383079  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0978  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 292 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0639197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0314  transcriptional regulator IclR-like protein  29.15 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  30.09 
 
 		 249 aa  99  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 273 aa  92.4  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.5 
 
 		 259 aa  92  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  25.2 
 
 		 262 aa  92  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  26.64 
 
 		 258 aa  89  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 262 aa  88.6  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  25.31 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4105  transcriptional regulator, IclR family  29.25 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  26.32 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  28.57 
 
 		 276 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  28.92 
 
 		 277 aa  87  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  30.64 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 272 aa  86.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  26.94 
 
 		 242 aa  86.3  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 260 aa  86.3  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3913  transcriptional regulator, IclR family  29.72 
 
 		 262 aa  85.9  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.48 
 
 		 252 aa  85.9  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 276 aa  85.9  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  28.9 
 
 		 276 aa  85.9  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 258 aa  85.5  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 261 aa  85.5  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  26.32 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4394  IclR family transcriptional regulator family  32.5 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  25.4 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  26.91 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  27.02 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  29.46 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  25.9 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  29.46 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  29.46 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  27.02 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  29.46 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  29.09 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  27.04 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  25.91 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  25.99 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  25.99 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.99 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  25.99 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.99 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.99 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  25.51 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2380  IclR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102909  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1062  IclR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.36 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2670  transcriptional regulator, IclR family  26.23 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0516  transcriptional regulator, IclR family  27.5 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  28.28 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 250 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 250 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  26.61 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  26.86 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3687  transcriptional regulator, IclR family  27.01 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  26.61 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  26.19 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3884  transcriptional regulator, IclR family  27.01 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0724  transcriptional regulator, IclR family  29.05 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3974  transcriptional regulator, IclR family  26.51 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.482822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3216  IclR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  26.61 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  26.61 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  26.61 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  27.35 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  26.61 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  26.61 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  29.46 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  28.74 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2718  transcriptional regulator, IclR family  26.55 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  28.74 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2586  IclR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.556667  normal  0.947412 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4071  IclR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  27.6 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  26.64 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>