More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1550 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
276 aa  547  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  99.28 
 
 
276 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  89.49 
 
 
276 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  46.82 
 
 
284 aa  238  9e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  46.42 
 
 
280 aa  237  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  45.04 
 
 
269 aa  233  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  46.04 
 
 
282 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  41.35 
 
 
280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  41.44 
 
 
295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  44.4 
 
 
279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  39.03 
 
 
273 aa  196  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  44.19 
 
 
275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  39.37 
 
 
279 aa  175  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  37.63 
 
 
274 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  37.63 
 
 
274 aa  169  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  37.63 
 
 
274 aa  169  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  37.63 
 
 
274 aa  169  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  37.63 
 
 
274 aa  169  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  37.63 
 
 
274 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  37.63 
 
 
274 aa  169  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  37.63 
 
 
274 aa  169  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  36.92 
 
 
274 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  36.92 
 
 
274 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  36.92 
 
 
274 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  36.92 
 
 
274 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  36.92 
 
 
274 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  37.5 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  34.78 
 
 
280 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  34.78 
 
 
280 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  34.78 
 
 
280 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  35.74 
 
 
277 aa  159  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  35.47 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  33.83 
 
 
271 aa  155  8e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  33.46 
 
 
271 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  33.46 
 
 
271 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  33.46 
 
 
271 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  33.46 
 
 
271 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  33.46 
 
 
271 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  33.46 
 
 
271 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  33.09 
 
 
276 aa  149  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  33.81 
 
 
277 aa  149  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  31.88 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  32.53 
 
 
256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  32.53 
 
 
256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  31.16 
 
 
277 aa  145  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0481  transcriptional regulator IclR  37.74 
 
 
284 aa  145  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  29.72 
 
 
256 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0565  DNA-binding transcriptional repressor AllR  33.83 
 
 
272 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0624  DNA-binding transcriptional repressor AllR  33.83 
 
 
272 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10241  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0563  DNA-binding transcriptional repressor AllR  33.83 
 
 
272 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0570  DNA-binding transcriptional repressor AllR  33.83 
 
 
272 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  36.44 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  32.41 
 
 
261 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  33.74 
 
 
268 aa  136  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  32.4 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1841  IclR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
261 aa  133  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.292515  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 
280 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
261 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
260 aa  125  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
283 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  32.28 
 
 
252 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  33.48 
 
 
255 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  30.67 
 
 
258 aa  122  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  27.53 
 
 
263 aa  122  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
262 aa  122  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
254 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  30.89 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  33.75 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  31.1 
 
 
252 aa  119  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  35.47 
 
 
258 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19700  transcriptional regulator, IclR family  34.3 
 
 
272 aa  118  7.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.089385  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  26.32 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  32 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  27.13 
 
 
263 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  27.13 
 
 
263 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  32.02 
 
 
267 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  27.13 
 
 
263 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  27.13 
 
 
263 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  27.13 
 
 
263 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  26.32 
 
 
263 aa  115  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  26.32 
 
 
263 aa  115  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  31.47 
 
 
277 aa  115  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.32 
 
 
263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  26.32 
 
 
263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  26.32 
 
 
263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  27.95 
 
 
251 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  26.32 
 
 
263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  26.32 
 
 
263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  26.32 
 
 
263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3532  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 
256 aa  115  7.999999999999999e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  26.83 
 
 
260 aa  115  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  32.88 
 
 
254 aa  115  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4391  transcriptional regulator, IclR family  30.4 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.143749  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  29.28 
 
 
257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>