More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0668 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  100 
 
 
242 aa  493  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  60.58 
 
 
266 aa  305  6e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  58.23 
 
 
269 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  58.23 
 
 
268 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  58.23 
 
 
268 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  57.38 
 
 
268 aa  271  9e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  57.81 
 
 
270 aa  270  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  57.81 
 
 
270 aa  270  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  54.62 
 
 
259 aa  270  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  57.81 
 
 
270 aa  270  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  57.81 
 
 
270 aa  270  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  57.38 
 
 
269 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  57.38 
 
 
269 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1946  transcriptional regulator, IclR family  53.78 
 
 
270 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  57.38 
 
 
269 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  57.38 
 
 
269 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1776  IclR family transcriptional regulator  53.78 
 
 
270 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  56.96 
 
 
269 aa  268  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2376  transcriptional regulator, IclR family  54.81 
 
 
281 aa  268  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157038  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  56.96 
 
 
269 aa  268  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4860  IclR family transcriptional regulator  54.43 
 
 
274 aa  267  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  57.38 
 
 
270 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  57.38 
 
 
270 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  57.38 
 
 
270 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  57.38 
 
 
270 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  53.53 
 
 
259 aa  264  8.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  55.79 
 
 
262 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  52.32 
 
 
263 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  53.94 
 
 
277 aa  260  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  55.27 
 
 
261 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  52.74 
 
 
270 aa  259  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.184655 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3624  regulatory proteins, IclR  53.36 
 
 
286 aa  258  8e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2099  IclR family transcriptional regulator  54.85 
 
 
257 aa  258  8e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.734801  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  53.59 
 
 
256 aa  256  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  55.88 
 
 
265 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  55.88 
 
 
265 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1610  transcription regulator protein  55.27 
 
 
266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  50 
 
 
257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1081  transcriptional regulator, IclR family  54.85 
 
 
259 aa  221  7e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199562  normal  0.251697 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4891  IclR family transcriptional regulator  40 
 
 
262 aa  195  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
273 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
272 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  38.75 
 
 
259 aa  159  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
268 aa  146  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1365  transcriptional regulator, IclR family  38.6 
 
 
259 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.490803  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1668  transcriptional regulator, IclR family  38.6 
 
 
259 aa  145  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.145248  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  37.76 
 
 
277 aa  145  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  34.29 
 
 
254 aa  142  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  31.3 
 
 
257 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0198  Transcriptional regulator IclR  41.24 
 
 
265 aa  142  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101079  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  35.54 
 
 
280 aa  141  7e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 
265 aa  141  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0758  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
262 aa  139  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00765311  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  31.82 
 
 
256 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  31.95 
 
 
261 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  37.77 
 
 
258 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  29.34 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  33.05 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  37.71 
 
 
252 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  35 
 
 
279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 
246 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  30 
 
 
246 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  31.95 
 
 
283 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  36.89 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  29.27 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
258 aa  129  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
267 aa  129  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  36.97 
 
 
299 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3778  IclR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  30.53 
 
 
250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3897  IclR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03426  predicted DNA-binding transcriptional repressor  29.1 
 
 
282 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0136  transcriptional regulator, IclR family  29.1 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0140  IclR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03377  hypothetical protein  29.1 
 
 
282 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3948  transcriptional regulator, IclR family  29.1 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0516  transcriptional regulator, IclR family  28.05 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  32.92 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
269 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  39.63 
 
 
267 aa  126  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  32.06 
 
 
255 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  30.04 
 
 
295 aa  125  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  36.15 
 
 
255 aa  125  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4071  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
270 aa  125  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
272 aa  125  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  32.92 
 
 
262 aa  125  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
261 aa  125  9e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  32.89 
 
 
308 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3865  HTH-type transcriptional regulator  28.69 
 
 
266 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  31.97 
 
 
265 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
267 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
250 aa  123  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
263 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
263 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
284 aa  122  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>