More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1546 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
268 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  98.13 
 
 
268 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  96.11 
 
 
268 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  91.19 
 
 
270 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  91.57 
 
 
269 aa  485  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  91.19 
 
 
270 aa  484  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  91.57 
 
 
269 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  91.57 
 
 
269 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  91.57 
 
 
269 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  91.19 
 
 
270 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  91.19 
 
 
270 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  90.8 
 
 
270 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  90.8 
 
 
269 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  90.8 
 
 
269 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  90.8 
 
 
270 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  90.8 
 
 
270 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  90.8 
 
 
270 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  89.66 
 
 
269 aa  477  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  83.01 
 
 
262 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  81.47 
 
 
261 aa  425  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1610  transcription regulator protein  81.68 
 
 
266 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  82.75 
 
 
265 aa  418  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  82.75 
 
 
265 aa  418  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  75.5 
 
 
277 aa  384  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  73.58 
 
 
256 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1946  transcriptional regulator, IclR family  70.31 
 
 
270 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  72.22 
 
 
259 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1776  IclR family transcriptional regulator  70.31 
 
 
270 aa  366  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2099  IclR family transcriptional regulator  71.77 
 
 
257 aa  366  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.734801  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3624  regulatory proteins, IclR  71.37 
 
 
286 aa  363  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  70.31 
 
 
259 aa  362  4e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  69.72 
 
 
263 aa  361  6e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2376  transcriptional regulator, IclR family  72.95 
 
 
281 aa  360  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157038  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  69.44 
 
 
270 aa  359  3e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.184655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4860  IclR family transcriptional regulator  69.57 
 
 
274 aa  359  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1081  transcriptional regulator, IclR family  76.74 
 
 
259 aa  328  4e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199562  normal  0.251697 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  58.47 
 
 
266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  58.23 
 
 
242 aa  272  5.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  49.59 
 
 
257 aa  226  3e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4891  IclR family transcriptional regulator  42.75 
 
 
262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  45.74 
 
 
273 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1365  transcriptional regulator, IclR family  43.27 
 
 
259 aa  155  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.490803  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1668  transcriptional regulator, IclR family  42.86 
 
 
259 aa  152  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.145248  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  37.02 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  32.26 
 
 
252 aa  143  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  37.55 
 
 
277 aa  142  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  36.25 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  31.5 
 
 
256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  36.65 
 
 
254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
268 aa  132  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  30.65 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  31.71 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.92 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  28.92 
 
 
255 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  33.21 
 
 
262 aa  129  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  31.62 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  32.41 
 
 
252 aa  126  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
258 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  30.52 
 
 
257 aa  126  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  35.59 
 
 
255 aa  125  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  33.2 
 
 
255 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  36.9 
 
 
256 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  34.84 
 
 
258 aa  123  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  31.05 
 
 
252 aa  122  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
264 aa  122  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  34.94 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  30.36 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  30.61 
 
 
250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0758  IclR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
262 aa  119  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00765311  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
275 aa  119  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
249 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
249 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3687  transcriptional regulator, IclR family  31.6 
 
 
272 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  29.74 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  31.3 
 
 
263 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  34.82 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0516  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  36.11 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  31.87 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3884  transcriptional regulator, IclR family  31.6 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  37.5 
 
 
253 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  36.61 
 
 
257 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  30.38 
 
 
265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  29.8 
 
 
250 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
250 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
267 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  30.15 
 
 
263 aa  115  8.999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  35.95 
 
 
246 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  30.2 
 
 
250 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  29.69 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  35.29 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>