More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2571 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  100 
 
 		 258 aa  528  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  97.29 
 
 		 258 aa  515  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  66.8 
 
 		 268 aa  329  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  42.23 
 
 		 267 aa  198  7e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2778  IclR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0655324  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 272 aa  185  8e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  37.75 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 291 aa  174  9e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  37.85 
 
 		 259 aa  172  6.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  35.34 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  36.95 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  35.32 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  41.23 
 
 		 308 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  36.69 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  35.57 
 
 		 275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  32.66 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  32.54 
 
 		 260 aa  158  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 260 aa  158  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  36 
 
 		 265 aa  156  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  32.14 
 
 		 260 aa  155  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  36.14 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 246 aa  152  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  31.98 
 
 		 246 aa  152  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  35.74 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  31.85 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2381  IclR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 279 aa  149  6e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  37.33 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  37.04 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  35.96 
 
 		 277 aa  142  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  34.14 
 
 		 255 aa  141  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  32.38 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  32.24 
 
 		 254 aa  139  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  31.45 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  37.4 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  35.22 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  28.46 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  37.9 
 
 		 249 aa  138  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  30.98 
 
 		 277 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  38.5 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.65 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  35.65 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  39.82 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  35.65 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  35.65 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  35.65 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  35.65 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  35.65 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  34.78 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  36.28 
 
 		 281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  32.86 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  34.07 
 
 		 258 aa  135  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  34.35 
 
 		 263 aa  135  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 267 aa  135  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 260 aa  135  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  33.91 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  33.05 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  34.63 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  30.92 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  30.92 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  30.92 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  32.52 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  33.85 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.05 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  37 
 
 		 276 aa  132  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 250 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  33.48 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  32.4 
 
 		 269 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  30.56 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  30.56 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  31.3 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  34.35 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  30.56 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  34.35 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>