More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2778 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2778  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  516  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0655324  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2381  IclR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 279 aa  214  9e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  40.94 
 
 		 258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  42.11 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 291 aa  179  4.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2810  IclR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.162852  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  39.29 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  35.34 
 
 		 275 aa  138  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  33.07 
 
 		 265 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  30.92 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0190  IclR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 241 aa  125  8.000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.49367  normal  0.390724 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  30.52 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  32.26 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  31.5 
 
 		 255 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 260 aa  121  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  27.71 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 267 aa  117  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  30.65 
 
 		 280 aa  115  8.999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  28.51 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 267 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  28.11 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  28.29 
 
 		 267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 268 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  32.88 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  30.68 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  28.92 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2736  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  31.42 
 
 		 253 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  30.13 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  33.79 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  28.69 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  28.69 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5946  IclR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 266 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  29.11 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  31.02 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  32.52 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  27.87 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  31.82 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  31.53 
 
 		 280 aa  99.8  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 277 aa  99.4  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 269 aa  99.8  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  26.29 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 259 aa  99.4  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3416  transcriptional regulator, IclR family  34.8 
 
 		 257 aa  99  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0639  transcriptional regulator PcaR, putative  30.59 
 
 		 256 aa  99  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 261 aa  99  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 276 aa  98.6  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 256 aa  98.6  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  33.16 
 
 		 249 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 261 aa  97.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0601  putative transcriptional regulator PcaR  30.59 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  31.05 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  27.87 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5069  transcriptional regulator, IclR family  31.22 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.469933  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  32.81 
 
 		 277 aa  97.1  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3996  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2788  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.031926 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  26.27 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  27.24 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  33.95 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 283 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  30.04 
 
 		 262 aa  96.7  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3913  transcriptional regulator, IclR family  30.25 
 
 		 262 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3768  IclR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 274 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  32.67 
 
 		 262 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  36.53 
 
 		 262 aa  96.3  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 262 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 269 aa  96.7  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  32.67 
 
 		 262 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  31.33 
 
 		 267 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 260 aa  96.3  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  31.6 
 
 		 303 aa  95.9  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5019  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  30.36 
 
 		 252 aa  95.9  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2460  transcriptional regulator, IclR family  33.95 
 
 		 263 aa  95.5  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  30.65 
 
 		 269 aa  95.5  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4105  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 262 aa  95.5  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  32.9 
 
 		 266 aa  95.5  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 264 aa  95.5  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  32.9 
 
 		 266 aa  95.5  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  28.98 
 
 		 277 aa  95.5  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  27.46 
 
 		 260 aa  95.1  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  26.91 
 
 		 265 aa  95.5  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.46 
 
 		 278 aa  95.1  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2255  transcription regulator protein  31.8 
 
 		 275 aa  95.1  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  33.02 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  26.1 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  29.86 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>