More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5069 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5069  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 251 aa  504  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.469933  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0571  transcriptional regulator, IclR family  41.41 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3050  regulatory proteins, IclR  39.92 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1951  transcriptional regulator, IclR family  41.18 
 
 		 261 aa  151  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0572  transcriptional regulator, IclR family  39.48 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1929  transcriptional regulator, IclR family  38.56 
 
 		 258 aa  138  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.873364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0578  IclR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 270 aa  122  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  36.17 
 
 		 258 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  34.06 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0663  transcriptional regulator, IclR family  33.91 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  32.46 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1748  IclR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  33.61 
 
 		 308 aa  105  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1955  IclR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  29.87 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  29.87 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  29.87 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  29.87 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  29.87 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1301  transcriptional regulator, IclR family  34.36 
 
 		 880 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203526 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  29.87 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  29.87 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  29.87 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38610  transcriptional regulator  33.05 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21340  transcriptional regulator  35.96 
 
 		 247 aa  102  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  32.26 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0846  transcriptional regulator, IclR family  36.65 
 
 		 252 aa  99.8  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.731072  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  30.53 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  27.75 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  32.27 
 
 		 267 aa  99.4  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  29.44 
 
 		 274 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  29.44 
 
 		 274 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  29.44 
 
 		 274 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  29.44 
 
 		 274 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  29.44 
 
 		 274 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 260 aa  98.6  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 260 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  29.49 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  32.16 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  34.58 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2778  IclR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0655324  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2326  IclR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 257 aa  97.1  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00931512  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 269 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  30.64 
 
 		 268 aa  95.5  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  36 
 
 		 257 aa  95.5  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  33.47 
 
 		 277 aa  95.5  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 254 aa  93.6  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  37.56 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0897  regulatory proteins, IclR  33.47 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 260 aa  93.2  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  28.57 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  34.95 
 
 		 277 aa  93.2  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  28.57 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  30.7 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  28.57 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1099  transcriptional regulator, IclR family  35.43 
 
 		 257 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 267 aa  92.8  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1587  transcriptional regulator, IclR family  35.09 
 
 		 835 aa  92.4  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0088004 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11734  transcriptional regulator  36.58 
 
 		 259 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 261 aa  91.7  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  30.74 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  32.61 
 
 		 267 aa  91.3  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  31.14 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  34.36 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3768  regulatory proteins, IclR  36.1 
 
 		 252 aa  91.3  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000320776  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  34.3 
 
 		 265 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 260 aa  89.7  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6149  IclR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 261 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.508102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  30.26 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  32.2 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2407  IclR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  31.72 
 
 		 279 aa  89.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  34.68 
 
 		 258 aa  89.4  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 284 aa  89  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  31.65 
 
 		 279 aa  89  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  33.19 
 
 		 249 aa  89  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 280 aa  88.6  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  32.38 
 
 		 254 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27.51 
 
 		 256 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  29.82 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  33.64 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  28.57 
 
 		 277 aa  87  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  35.78 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  33.64 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  27.71 
 
 		 276 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  33.64 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3479  regulatory proteins, IclR  32.67 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0476526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  34.65 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>