More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0190 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0190  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  484  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.49367  normal  0.390724 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2778  IclR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 253 aa  125  7e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0655324  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2736  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  33.63 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  31.36 
 
 		 258 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2381  IclR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 279 aa  97.1  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  27.71 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  28.64 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  27.71 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  26.18 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  26.61 
 
 		 275 aa  78.6  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  26.75 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3829  transcriptional regulator, IclR family  30.49 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0906  regulatory proteins, IclR  30.26 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  29.05 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5126  transcriptional regulator, IclR family  31.28 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2810  IclR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.162852  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  24.88 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3768  IclR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  24.66 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.5 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1022  Transcriptional regulator IclR  29.17 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157086  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2788  transcriptional regulator, IclR family  29.63 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.031926 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1344  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.491684  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  27.15 
 
 		 274 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2024  transcriptional regulator, IclR family  31.84 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.276218  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4608  IclR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249268  normal  0.348784 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  26.7 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  27.73 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  29.6 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  30.14 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2255  transcription regulator protein  27.63 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2460  transcriptional regulator, IclR family  28.7 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4901  IclR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2997  IclR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5369  IclR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3497  IclR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0408  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.317858  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5069  transcriptional regulator, IclR family  36.7 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.469933  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  29.09 
 
 		 267 aa  68.6  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0496  regulatory protein, IclR  27.94 
 
 		 287 aa  68.6  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0480  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  25.79 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0382  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  25.79 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1491  IclR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1811  IclR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0797  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  25.79 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2114  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  25.79 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.247685  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  26.91 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  25.99 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18740  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.691347  normal  0.112015 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  26.34 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  28.25 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  25.42 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  31.21 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1955  IclR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5543  regulatory protein, IclR  29.02 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452687  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0808  transcriptional regulator, IclR family  26.94 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3937  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.793317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  29.06 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2127  IclR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 285 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5560  IclR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0645  transcriptional regulator, IclR family  28.94 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  29.15 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  23.17 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  31.31 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  28.02 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0440  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  29.6 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3416  transcriptional regulator, IclR family  27.07 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  26.45 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  32.41 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  32.41 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  31.13 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1638  transcriptional regulator IclR-like protein  28.12 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318022  normal  0.187362 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  26.73 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>