More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0496 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0496  regulatory protein, IclR  100 
 
 		 287 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4608  IclR family transcriptional regulator  96.86 
 
 		 255 aa  491  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249268  normal  0.348784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7484  IclR family transcriptional regulator  76.47 
 
 		 261 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5126  transcriptional regulator, IclR family  71.37 
 
 		 255 aa  357  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3648  transcriptional regulator, IclR family  57.47 
 
 		 263 aa  275  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1022  Transcriptional regulator IclR  54.76 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157086  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5303  transcriptional regulator, IclR family  52.59 
 
 		 253 aa  228  9e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5039  transcriptional regulator, IclR family  54.8 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1099  transcriptional regulator, IclR family  43.03 
 
 		 257 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 280 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 260 aa  119  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  31.2 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  30.71 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  30.89 
 
 		 259 aa  112  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  32.28 
 
 		 252 aa  112  9e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  29.25 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  31.9 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  29.73 
 
 		 257 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 260 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  29.2 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  29.32 
 
 		 255 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27.71 
 
 		 256 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  35.32 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  35.32 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  27.78 
 
 		 248 aa  102  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  28.79 
 
 		 263 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  28.79 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 263 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  28.97 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  29.18 
 
 		 253 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 263 aa  99.8  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 267 aa  99.4  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  28 
 
 		 260 aa  98.6  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  30.92 
 
 		 265 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  28 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  28.44 
 
 		 260 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 268 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  26.98 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  29.51 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  29.57 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18740  transcriptional regulator  33.94 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.691347  normal  0.112015 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  29.57 
 
 		 263 aa  96.7  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 260 aa  96.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  30.32 
 
 		 257 aa  96.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 260 aa  96.7  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  26.59 
 
 		 251 aa  96.3  5e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  27.63 
 
 		 263 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  33.46 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2127  IclR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.19 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  31.39 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  28.19 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  28.19 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  28.4 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  27.59 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  28.19 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  28.19 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  28.19 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 269 aa  92.8  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 269 aa  93.2  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  32.27 
 
 		 277 aa  92.8  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0162  transcriptional regulator, IclR family  32.21 
 
 		 257 aa  92.4  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 268 aa  92.4  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  29.48 
 
 		 276 aa  92  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  28.14 
 
 		 263 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  28.14 
 
 		 263 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 259 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  28.14 
 
 		 263 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  28.14 
 
 		 263 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  28.14 
 
 		 263 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  28.02 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1491  IclR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 285 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1811  IclR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 285 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  28 
 
 		 261 aa  90.5  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  29.3 
 
 		 277 aa  90.1  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  28.52 
 
 		 276 aa  90.1  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  26.07 
 
 		 263 aa  90.5  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4434  transcriptional regulator, IclR family  30.67 
 
 		 261 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0001758  normal  0.639145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  31.87 
 
 		 255 aa  90.1  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2259  IclR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 260 aa  90.1  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.0000000211035 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  29.41 
 
 		 277 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  30.68 
 
 		 265 aa  89.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 247 aa  89.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  28.57 
 
 		 274 aa  89  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4432  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 271 aa  89  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 263 aa  89  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  28.57 
 
 		 274 aa  89  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  28.57 
 
 		 274 aa  89  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>