More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1955 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1955  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 268 aa  508  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38610  transcriptional regulator  39.62 
 
 		 268 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  30.61 
 
 		 265 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1748  IclR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 247 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0663  transcriptional regulator, IclR family  35.57 
 
 		 279 aa  108  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 259 aa  108  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  33.92 
 
 		 252 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  33.33 
 
 		 252 aa  106  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 262 aa  106  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5069  transcriptional regulator, IclR family  34.02 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.469933  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  34.62 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  32.79 
 
 		 258 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 291 aa  102  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  32.43 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  31.49 
 
 		 254 aa  99.4  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 263 aa  99  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21340  transcriptional regulator  34.67 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 283 aa  96.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  28.46 
 
 		 255 aa  95.9  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1951  transcriptional regulator, IclR family  33.88 
 
 		 261 aa  95.5  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0846  transcriptional regulator, IclR family  34.39 
 
 		 252 aa  95.5  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.731072  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 259 aa  95.5  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  34.5 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  28.2 
 
 		 276 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1301  transcriptional regulator, IclR family  35.6 
 
 		 880 aa  94  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203526 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 250 aa  93.6  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3768  regulatory proteins, IclR  37.25 
 
 		 252 aa  93.6  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000320776  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  35.45 
 
 		 279 aa  93.2  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 260 aa  92.8  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  35.53 
 
 		 258 aa  92.4  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1587  transcriptional regulator, IclR family  35.68 
 
 		 835 aa  92  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0088004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.8 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2778  IclR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0655324  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0572  transcriptional regulator, IclR family  35.41 
 
 		 254 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 273 aa  90.1  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4105  transcriptional regulator, IclR family  27.67 
 
 		 262 aa  89.7  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0408  IclR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 251 aa  89.7  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.317858  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0571  transcriptional regulator, IclR family  32.7 
 
 		 266 aa  89.7  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  29.37 
 
 		 253 aa  89.4  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  29.51 
 
 		 260 aa  89.4  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 259 aa  89  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 268 aa  89  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  27.07 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0041  IclR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 288 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.75 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  32.14 
 
 		 256 aa  88.6  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3913  transcriptional regulator, IclR family  28.33 
 
 		 262 aa  86.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  24.89 
 
 		 257 aa  86.7  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  31.73 
 
 		 248 aa  86.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 246 aa  86.3  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  29.18 
 
 		 246 aa  86.3  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18740  transcriptional regulator  33.05 
 
 		 261 aa  85.9  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.691347  normal  0.112015 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 267 aa  85.5  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 256 aa  85.9  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  29.83 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  35.75 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1022  Transcriptional regulator IclR  33.84 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157086  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  26.09 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  33.86 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  32.39 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  36.46 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3389  transcriptional regulator, IclR family, C-terminal domain  30.7 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  29.76 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  29.72 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  35.62 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19700  transcriptional regulator, IclR family  35.5 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.089385  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  30.95 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  29.96 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  31.66 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  24.34 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2259  IclR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.0000000211035 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2407  IclR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  29.95 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  33.05 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3050  regulatory proteins, IclR  28.89 
 
 		 251 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02174  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.26 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1410  transcriptional regulator, IclR family  30.26 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1401  IclR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.509968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  26.92 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  32.39 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  31.56 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  26.92 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>