More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3768 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3768  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 252 aa  494  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000320776  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21340  transcriptional regulator  56.42 
 
 		 247 aa  224  9e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1748  IclR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 247 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0846  transcriptional regulator, IclR family  54.71 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.731072  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38610  transcriptional regulator  40.6 
 
 		 268 aa  119  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0897  regulatory proteins, IclR  38.03 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  37.21 
 
 		 257 aa  112  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5944  transcriptional regulator, IclR family  35.53 
 
 		 268 aa  112  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4448  IclR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  34.68 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  36.16 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  38.36 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  31.43 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 256 aa  96.7  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5069  transcriptional regulator, IclR family  35.4 
 
 		 251 aa  96.3  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.469933  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1955  IclR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 268 aa  96.3  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4050  regulatory protein, IclR  35.38 
 
 		 262 aa  95.9  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 283 aa  95.9  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 272 aa  92  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 		 257 aa  92  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1929  transcriptional regulator, IclR family  31.25 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.873364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  29.73 
 
 		 261 aa  86.3  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  35.05 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  34.23 
 
 		 258 aa  85.5  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  31.28 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  31.92 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4375  transcriptional regulator, IclR family  31.82 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  27.09 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  28.24 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4954  transcriptional regulator, IclR family  26.78 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0571  transcriptional regulator, IclR family  33 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  27.35 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0572  transcriptional regulator, IclR family  34.58 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3050  regulatory proteins, IclR  30.73 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  31.76 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1951  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  31.46 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1433  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 550 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  28.45 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  32.74 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  28.7 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  27.6 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  33.05 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  29.6 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  31.51 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  29.36 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  28.83 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  29.36 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  30.49 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  29.36 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  27.15 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1512  IclR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.388908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  32.41 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2788  transcriptional regulator, IclR family  32.7 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.031926 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  28.51 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  30.65 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  30.09 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 250 aa  72  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  26.36 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0905  IclR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.818194  normal  0.447729 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1301  transcriptional regulator, IclR family  31.2 
 
 		 880 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203526 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13880  transcriptional regulatory protein, IclR family  28.8 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176969  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  30.97 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4529  IclR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143169 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  26.7 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  31.68 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  26.24 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  27.23 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2006  IclR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  29.73 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  27.84 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>