More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0571 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0571  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 
266 aa  529  1e-149  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138333  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0572  transcriptional regulator, IclR family  67.48 
 
 
254 aa  317  1e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1951  transcriptional regulator, IclR family  59.68 
 
 
261 aa  256  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3050  regulatory proteins, IclR  48.54 
 
 
251 aa  205  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1929  transcriptional regulator, IclR family  44.54 
 
 
258 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.873364  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0578  IclR family transcriptional regulator  40.56 
 
 
270 aa  170  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5069  transcriptional regulator, IclR family  40.57 
 
 
251 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.469933  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  35.9 
 
 
275 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  32.22 
 
 
294 aa  105  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  32.47 
 
 
278 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0663  transcriptional regulator, IclR family  33.01 
 
 
279 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 
261 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
275 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  34.98 
 
 
255 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  26.64 
 
 
260 aa  99  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38610  transcriptional regulator  31.25 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  32.21 
 
 
272 aa  95.9  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2809  transcriptional regulator, IclR family  32.2 
 
 
278 aa  95.5  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  30.68 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  29.66 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 
256 aa  93.2  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  32 
 
 
255 aa  92.8  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  25.33 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  32.5 
 
 
280 aa  90.9  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  34 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1955  IclR family transcriptional regulator  32.7 
 
 
268 aa  90.1  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  29.08 
 
 
277 aa  89.7  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  25.76 
 
 
260 aa  89.4  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  24.89 
 
 
260 aa  89  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  30 
 
 
267 aa  89  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  31.84 
 
 
255 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  28.21 
 
 
258 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
550 aa  87.8  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
263 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
254 aa  87.8  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  29.03 
 
 
265 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
267 aa  86.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  31.56 
 
 
260 aa  87  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  28.12 
 
 
267 aa  85.9  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21340  transcriptional regulator  33.66 
 
 
247 aa  85.5  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4521  IclR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
299 aa  85.5  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.948737 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.44 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  25.63 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  31.58 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2326  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00931512  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  30.58 
 
 
258 aa  85.1  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4448  IclR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  30.6 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4784  transcriptional regulator, IclR family  31.39 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.820047  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2939  transcriptional regulator, IclR family  30.91 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  26.84 
 
 
261 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  26.26 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  26 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  25.94 
 
 
254 aa  84  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4215  transcriptional regulator, IclR family  34.27 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0022938  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  31.43 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2110  transcriptional regulator IclR-like protein  32.06 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.966848 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  28.51 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  30.17 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  30.89 
 
 
308 aa  82  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4517  regulatory protein, IclR  28.24 
 
 
255 aa  82  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530625  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  29.52 
 
 
277 aa  82  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  29.75 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  32.78 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  35.03 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1748  IclR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  33.17 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  32.78 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1946  transcriptional regulator, IclR family  30.93 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  26.78 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  28.57 
 
 
280 aa  80.1  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  28.57 
 
 
280 aa  80.1  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  28.57 
 
 
280 aa  80.1  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3768  regulatory proteins, IclR  33 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000320776  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1776  IclR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5944  transcriptional regulator, IclR family  25.78 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  28.57 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  29.74 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2600  IclR family transcriptional regulator  27.16 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.248836 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  28.16 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  31.2 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  28.16 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  28.16 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  28.16 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  29.6 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  28.16 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  27.36 
 
 
257 aa  79  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  24.9 
 
 
263 aa  79  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  30.04 
 
 
269 aa  79  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
264 aa  79  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
291 aa  79  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  30.2 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>