More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0663 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0663  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 279 aa  559  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38610  transcriptional regulator  44.17 
 
 		 268 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1748  IclR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5069  transcriptional regulator, IclR family  33.48 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.469933  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1955  IclR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0571  transcriptional regulator, IclR family  33.01 
 
 		 266 aa  102  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21340  transcriptional regulator  36.77 
 
 		 247 aa  99.4  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0846  transcriptional regulator, IclR family  32.93 
 
 		 252 aa  99  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.731072  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  27.73 
 
 		 267 aa  94.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  32.02 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  30.9 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  30.45 
 
 		 260 aa  90.5  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  34.45 
 
 		 254 aa  89  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 260 aa  89  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  29.8 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0572  transcriptional regulator, IclR family  35.48 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  30.65 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  29.36 
 
 		 294 aa  86.7  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 278 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3050  regulatory proteins, IclR  29.13 
 
 		 251 aa  86.3  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 260 aa  85.5  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2854  transcriptional regulator, IclR family  31.89 
 
 		 285 aa  85.5  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  29.67 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  28.44 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  29.09 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5944  transcriptional regulator, IclR family  35.1 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  25.97 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  28.18 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  33.93 
 
 		 253 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2380  IclR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 254 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102909  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.44 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  34.91 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  31.73 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  32.44 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4448  IclR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 272 aa  78.6  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27.31 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 550 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0645  transcriptional regulator, IclR family  30.38 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  26.53 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1929  transcriptional regulator, IclR family  30.29 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.873364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  34.23 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  28.27 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4391  transcriptional regulator, IclR family  28.11 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.143749  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  29.22 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  28.46 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  26.67 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1951  transcriptional regulator, IclR family  30.67 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  28 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4215  transcriptional regulator, IclR family  29.15 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0022938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  28.94 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  28.51 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4050  regulatory protein, IclR  28.1 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0327  transcriptional regulator, IclR family  27.87 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  28.72 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0897  regulatory proteins, IclR  29.33 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  28.31 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  25.76 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  30.46 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2778  IclR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0655324  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  29.49 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  28.76 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4432  IclR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  32 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  29.22 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4402  regulatory proteins, IclR  32.11 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  28.82 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3624  regulatory proteins, IclR  27.35 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  26.91 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3844  transcriptional regulator, IclR family  28.9 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  29.15 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  26.75 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  28.41 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  24.11 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  24.11 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>