More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4448 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4448  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  517  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4050  regulatory protein, IclR  92.28 
 
 		 262 aa  462  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5944  transcriptional regulator, IclR family  54.88 
 
 		 268 aa  270  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38610  transcriptional regulator  34.93 
 
 		 268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0846  transcriptional regulator, IclR family  36.02 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.731072  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3768  regulatory proteins, IclR  36.28 
 
 		 252 aa  106  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000320776  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1748  IclR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21340  transcriptional regulator  33.48 
 
 		 247 aa  93.2  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0571  transcriptional regulator, IclR family  30.37 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0572  transcriptional regulator, IclR family  29.27 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0663  transcriptional regulator, IclR family  27.78 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0897  regulatory proteins, IclR  27.48 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1951  transcriptional regulator, IclR family  29.58 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5069  transcriptional regulator, IclR family  30.85 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.469933  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  28 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1955  IclR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3050  regulatory proteins, IclR  26.87 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  26.27 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  25.81 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  27.73 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  25.59 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0578  IclR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  30.23 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  29.01 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  28.94 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  27.8 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  25.82 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  25.54 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4394  IclR family transcriptional regulator family  29.61 
 
 		 336 aa  62.4  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  27.67 
 
 		 265 aa  62  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4716  transcriptional regulator, IclR family  30.65 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  27.62 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  28.4 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  28.16 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  26.24 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2326  IclR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00931512  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  27.89 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  23.5 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  27.73 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  23.76 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  27.4 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2981  transcriptional regulator, IclR family  26.56 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  30.17 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  26.63 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  31.55 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  23.92 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  28.11 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0822  transcriptional regulator, IclR family  26.48 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0896  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 91 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4375  transcriptional regulator, IclR family  27.09 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  25.86 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  28.37 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  28.63 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2259  IclR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.0000000211035 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  26.07 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  26.07 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  26.07 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  26.07 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  26.07 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  27.23 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  26.07 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  26.07 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  26.07 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1276  regulatory protein IclR  23.24 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  26.46 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  26.46 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  26.46 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  26.27 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  23.11 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0203  IclR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.670577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  26.46 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  26.27 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  26.46 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  26.27 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  27.38 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  25.93 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  28.23 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0430  IclR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0855586  normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 284 aa  55.5  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  32.06 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>