More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4391 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4391  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 
255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.143749  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0327  transcriptional regulator, IclR family  60.39 
 
 
254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4784  transcriptional regulator, IclR family  46.9 
 
 
257 aa  238  6.999999999999999e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.820047  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  45.56 
 
 
254 aa  230  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  43.5 
 
 
258 aa  227  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  43.14 
 
 
255 aa  223  3e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2238  transcriptional regulator, IclR family  46.44 
 
 
251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.399676  normal  0.216558 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4019  transcriptional regulator, IclR family  42.23 
 
 
258 aa  218  5e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  41.57 
 
 
255 aa  212  4.9999999999999996e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  45.45 
 
 
255 aa  209  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3665  transcriptional regulator, IclR family  44.94 
 
 
262 aa  209  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0824  transcriptional regulator, IclR family  43.72 
 
 
264 aa  209  4e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2252  transcriptional regulator, IclR family  43.72 
 
 
263 aa  208  8e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1075  transcriptional regulator, IclR family  42.69 
 
 
266 aa  204  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  41.9 
 
 
258 aa  199  3e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0947  transcriptional regulator, IclR family  43.53 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.264338 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3532  transcriptional regulator, IclR family  41.18 
 
 
256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  38.04 
 
 
262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  40.73 
 
 
254 aa  192  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3416  transcriptional regulator, IclR family  41.06 
 
 
257 aa  190  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4759  transcriptional regulator, IclR family  39.59 
 
 
256 aa  190  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.635938  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  37.94 
 
 
257 aa  183  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0808  transcriptional regulator, IclR family  40.89 
 
 
272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4669  transcriptional regulator, IclR family  40.73 
 
 
275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  40 
 
 
251 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  39.34 
 
 
250 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  38.21 
 
 
258 aa  179  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  37.45 
 
 
262 aa  177  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4879  transcriptional regulator, IclR family  37.8 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0822  transcriptional regulator, IclR family  34.94 
 
 
258 aa  172  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4647  transcriptional regulator, IclR family  36.48 
 
 
262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  40.98 
 
 
249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  36.59 
 
 
251 aa  159  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3666  transcriptional regulator, IclR family  37.86 
 
 
267 aa  159  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4139  transcriptional regulator, IclR family  40 
 
 
261 aa  158  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  38.08 
 
 
254 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0499  transcriptional regulator, IclR family  40 
 
 
258 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3940  transcriptional regulator, IclR family  39.02 
 
 
256 aa  150  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4730  transcriptional regulator, IclR family  34.63 
 
 
268 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  36.63 
 
 
259 aa  149  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2906  transcriptional regulator, IclR family  36.82 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2861  transcriptional regulator, IclR family  36.44 
 
 
248 aa  142  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  36.12 
 
 
261 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  35.37 
 
 
256 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4056  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  32.9 
 
 
252 aa  133  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3844  transcriptional regulator, IclR family  31.74 
 
 
270 aa  132  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0101  transcriptional regulator, TrmB  37.4 
 
 
249 aa  132  7.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
260 aa  131  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  34.14 
 
 
260 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 
260 aa  125  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
260 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  35.12 
 
 
258 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  32.68 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  34.63 
 
 
258 aa  119  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  36.6 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  30.84 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
256 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  30.77 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  31.96 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  29.88 
 
 
257 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  29.84 
 
 
260 aa  113  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  29.96 
 
 
276 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  36.14 
 
 
255 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  33.49 
 
 
254 aa  112  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  31.8 
 
 
255 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  30.92 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.66 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  29.88 
 
 
263 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  38.64 
 
 
268 aa  109  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  32.4 
 
 
275 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  32.13 
 
 
253 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  28 
 
 
280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  32.14 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  29.22 
 
 
263 aa  109  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
259 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  29.26 
 
 
273 aa  109  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  31.08 
 
 
252 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  29.46 
 
 
263 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  32.6 
 
 
277 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  28.14 
 
 
276 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  29.29 
 
 
277 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3913  transcriptional regulator, IclR family  28.11 
 
 
262 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  29.96 
 
 
252 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  33.33 
 
 
262 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  34.39 
 
 
259 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4105  transcriptional regulator, IclR family  27.85 
 
 
262 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  28.02 
 
 
277 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
276 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>