More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1092 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  508  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  56.91 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  53.5 
 
 		 260 aa  234  8e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  52.82 
 
 		 266 aa  225  6e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  51.03 
 
 		 252 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  44.62 
 
 		 281 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0759  transcriptional regulator, IclR family  44.94 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  45.83 
 
 		 257 aa  181  9.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2092  transcriptional regulator, IclR family  45.2 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321928 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0484  IclR family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0371471  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 272 aa  149  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  37.07 
 
 		 252 aa  140  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  38.25 
 
 		 259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  39.91 
 
 		 308 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  40.93 
 
 		 255 aa  135  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  44.44 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  38.62 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  34.02 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  36.64 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  34.5 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 251 aa  125  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  34.98 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  34.02 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  32.76 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  33.5 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  32.79 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  33.86 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  31.85 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.85 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  32.9 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  32.93 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  31.85 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  31.85 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  31.85 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  31.85 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  31.85 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  31.54 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0373  transcriptional regulator, IclR family  37.35 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  31.85 
 
 		 263 aa  119  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  36.95 
 
 		 251 aa  118  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  31.97 
 
 		 274 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  31.97 
 
 		 274 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  32.39 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  31.97 
 
 		 274 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  32.39 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  31.97 
 
 		 274 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  31.97 
 
 		 274 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  31.97 
 
 		 274 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  32.39 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  32.39 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  32.39 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  31.97 
 
 		 274 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  31.97 
 
 		 274 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  32.89 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  34.68 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  37.07 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  37.34 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  37.61 
 
 		 265 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  31.85 
 
 		 280 aa  115  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  31.85 
 
 		 280 aa  115  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  31.85 
 
 		 280 aa  115  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  37.29 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  32.93 
 
 		 276 aa  115  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4391  transcriptional regulator, IclR family  34.93 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.143749  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  33.9 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  31.95 
 
 		 263 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  34.5 
 
 		 254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 263 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  30.65 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  31.95 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  38.63 
 
 		 257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  33.78 
 
 		 253 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  33.33 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 260 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  30.24 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  37.5 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  35.27 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0327  transcriptional regulator, IclR family  35.84 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  32.69 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  30.36 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  32.11 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4080  transcriptional regulator, IclR family  40.19 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4192  transcriptional regulator, IclR family  40.19 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 275 aa  109  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>