More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0484 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0484  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 273 aa  553  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0371471  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2092  transcriptional regulator, IclR family  83.2 
 
 		 270 aa  407  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  49.23 
 
 		 281 aa  228  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  48.79 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0759  transcriptional regulator, IclR family  48.24 
 
 		 259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 252 aa  198  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  46.44 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  43.72 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  42.17 
 
 		 266 aa  172  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  37.15 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  36.03 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  33.72 
 
 		 255 aa  115  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  32.53 
 
 		 261 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  32.83 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4941  putative IclR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 301 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  33 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  30.71 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  32.13 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  30.88 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 283 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 251 aa  102  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 256 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  30.71 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  30.71 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  30.77 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  30.71 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  30.71 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  30.71 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  30.71 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  30.71 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  30.71 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  30.39 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  27.6 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  31.53 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  30.31 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  30.31 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  30.31 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  30.31 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  27.98 
 
 		 248 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  30.31 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  28.21 
 
 		 255 aa  99.4  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  32.02 
 
 		 252 aa  99  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5059  transcriptional regulator, IclR family  33.91 
 
 		 263 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.941275 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0807  IclR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.190425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4206  transcriptional regulator, IclR family  31.94 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.708464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  31.85 
 
 		 281 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  30.73 
 
 		 277 aa  97.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  33.06 
 
 		 261 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  31.82 
 
 		 259 aa  96.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1639  IclR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 273 aa  96.3  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0495627  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  31.9 
 
 		 299 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1276  regulatory protein IclR  26.69 
 
 		 271 aa  95.9  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0817  IclR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 252 aa  95.9  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.539423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 276 aa  95.5  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  27.42 
 
 		 279 aa  94.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1062  IclR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4192  transcriptional regulator, IclR family  35.96 
 
 		 251 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4080  transcriptional regulator, IclR family  35.96 
 
 		 251 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  33.87 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  32.63 
 
 		 274 aa  93.6  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  28.5 
 
 		 280 aa  92.4  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  28.5 
 
 		 280 aa  92.4  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  28.5 
 
 		 280 aa  92.4  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5123  transcriptional regulator, IclR family  31.3 
 
 		 255 aa  92  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 267 aa  91.3  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 324 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3341  IclR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2199  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  33 
 
 		 273 aa  91.3  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.745324  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  30.8 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  29.13 
 
 		 276 aa  91.3  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  30.84 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  32.08 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 286 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  28.22 
 
 		 257 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  27.69 
 
 		 286 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1587  IclR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 229 aa  90.1  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2434  transcriptional regulator, IclR family  31.48 
 
 		 255 aa  90.1  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0257982  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 238 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  28.86 
 
 		 254 aa  89.4  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  32.16 
 
 		 253 aa  89.4  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2380  IclR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 254 aa  89  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102909  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  27.45 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  28.51 
 
 		 260 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 284 aa  87.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  28.43 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  31.1 
 
 		 264 aa  86.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4402  regulatory proteins, IclR  31.13 
 
 		 256 aa  86.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  32.32 
 
 		 247 aa  86.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  29.13 
 
 		 262 aa  86.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  32.77 
 
 		 264 aa  86.3  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  27.75 
 
 		 258 aa  85.9  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  28.15 
 
 		 261 aa  86.3  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  30.81 
 
 		 277 aa  85.5  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>