More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0807 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0807  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 252 aa  521  1e-147  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.190425 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0817  IclR family transcriptional regulator  95.63 
 
 		 252 aa  501  1e-141  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.539423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1534  regulatory protein, IclR  59.59 
 
 		 259 aa  311  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4941  putative IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_004310  BR1639  IclR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 273 aa  158  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0495627  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1276  regulatory protein IclR  34.36 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1587  IclR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  26.97 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  24.7 
 
 		 281 aa  95.9  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  24.78 
 
 		 255 aa  95.5  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  23.89 
 
 		 258 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 272 aa  89.4  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0484  IclR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 273 aa  89.4  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0371471  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  25.29 
 
 		 257 aa  89.4  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 258 aa  88.6  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  25.69 
 
 		 254 aa  88.6  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4375  transcriptional regulator, IclR family  26.24 
 
 		 250 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  26.82 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 250 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2718  transcriptional regulator, IclR family  26.11 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  26.52 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  25.11 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  24.59 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  28.33 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  22.75 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  26.98 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  24.68 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3913  transcriptional regulator, IclR family  23.73 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3127  IclR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0997  IclR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0217  transcriptional regulator, IclR family  27.19 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4080  transcriptional regulator, IclR family  24.38 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2092  transcriptional regulator, IclR family  27.45 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321928 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4105  transcriptional regulator, IclR family  22.88 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  28.23 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4192  transcriptional regulator, IclR family  24.38 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  23.66 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  23 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2459  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.383582  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4402  regulatory proteins, IclR  23.21 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  24.56 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0939  IclR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5093  transcriptional regulator  23.02 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04160  transcriptional regulator, IclR family  25.79 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0647577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  26.91 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  24.11 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0340  IclR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  22.22 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  22.83 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  25.76 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  23.77 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  25.57 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  23.25 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3480  transcriptional regulator, IclR family  23.5 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5059  transcriptional regulator, IclR family  27.46 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.941275 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  24.02 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2705  transcriptional regulator, IclR family  22.22 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  24.88 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  24.07 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4781  transcriptional regulator, IclR family  25.33 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  22.27 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4215  transcriptional regulator, IclR family  25.56 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0022938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2402  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  24 
 
 		 550 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02174  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1410  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  21.03 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2390  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02133  hypothetical protein  25 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1401  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.509968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  22.84 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3341  IclR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3389  transcriptional regulator, IclR family, C-terminal domain  25 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8459  transcriptional regulator, IclR family  24.17 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5946  IclR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  20.63 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1454  IclR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6702  transcriptional regulator, IclR family  21.91 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.136407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>