More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3754 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  100 
 
 		 275 aa  555  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  70.4 
 
 		 294 aa  363  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  71.43 
 
 		 278 aa  359  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  71.25 
 
 		 275 aa  360  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4215  transcriptional regulator, IclR family  53.31 
 
 		 258 aa  243  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0022938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 250 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4375  transcriptional regulator, IclR family  45.75 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 252 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 250 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4521  IclR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 299 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.948737 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  41.32 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4381  transcriptional regulator, IclR family  41.67 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6219  IclR family transcriptional regulator  40.42 
 
 		 254 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0700  IclR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 254 aa  178  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456524  decreased coverage  0.00240678 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  39.75 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4376  transcriptional regulator, IclR family  42.17 
 
 		 278 aa  175  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0697  IclR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 293 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.734635  decreased coverage  0.00216711 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  44.34 
 
 		 271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6222  IclR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 269 aa  169  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4529  IclR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143169 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0800  transcriptional regulator  41.86 
 
 		 260 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2006  IclR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  37.7 
 
 		 254 aa  162  8.000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0296  transcriptional regulator IclR-like protein  34.43 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4595  IclR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3350  transcriptional regulator IclR  35.25 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1512  IclR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 252 aa  148  7e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.388908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0905  IclR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.818194  normal  0.447729 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5946  IclR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0417  IclR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0284942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 272 aa  139  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13880  transcriptional regulatory protein, IclR family  33.2 
 
 		 267 aa  138  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176969  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1433  IclR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 255 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4954  transcriptional regulator, IclR family  31.3 
 
 		 265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1785  IclR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 272 aa  132  6e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  32.2 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  32.13 
 
 		 262 aa  123  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  32.37 
 
 		 255 aa  118  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  32.37 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  27.95 
 
 		 263 aa  116  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  31.48 
 
 		 257 aa  116  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0571  transcriptional regulator, IclR family  35.9 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 258 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  29.64 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  29.64 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  29.64 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  29.64 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  29.64 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6149  IclR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.508102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  27.95 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  29.64 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  29.64 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  29.64 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  27.95 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  32.77 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  27.95 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  29.72 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  27.95 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  26.78 
 
 		 261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  29.92 
 
 		 275 aa  112  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 282 aa  112  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  30.3 
 
 		 277 aa  112  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 273 aa  112  8.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  29.25 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  29.25 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  29.25 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  29.25 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  29.25 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  33.33 
 
 		 277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  30.67 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.56 
 
 		 263 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  27.56 
 
 		 263 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  27.56 
 
 		 263 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 263 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  27.56 
 
 		 263 aa  108  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  27.56 
 
 		 263 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  27.56 
 
 		 263 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  27.56 
 
 		 263 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  27.92 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  33.89 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1070  regulatory proteins, IclR  31.75 
 
 		 205 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  29.71 
 
 		 279 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 550 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  27.17 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  31.82 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  30.23 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  27.95 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  31.51 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  28.51 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  27.67 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  27.67 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>