More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1534 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1534  regulatory protein, IclR  100 
 
 		 259 aa  537  9.999999999999999e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0817  IclR family transcriptional regulator  60.41 
 
 		 252 aa  314  9e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.539423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0807  IclR family transcriptional regulator  59.59 
 
 		 252 aa  311  4.999999999999999e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.190425 
 
 
-
 
NC_004310  BR1639  IclR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 273 aa  182  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0495627  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1587  IclR family transcriptional regulator  40 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1276  regulatory protein IclR  36.76 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4941  putative IclR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 301 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  28.26 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  29.51 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  25.91 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  26.02 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  26.45 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  29.03 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  27.71 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  26.69 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 267 aa  93.2  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  24.57 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3127  IclR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 267 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 259 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1946  transcriptional regulator, IclR family  26.89 
 
 		 270 aa  90.5  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 282 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1776  IclR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 270 aa  90.5  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  27.56 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  29.9 
 
 		 257 aa  89.7  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2705  transcriptional regulator, IclR family  24.41 
 
 		 290 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  26.34 
 
 		 267 aa  89  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3341  IclR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 277 aa  89  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  27.05 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  29.66 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4192  transcriptional regulator, IclR family  25.73 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4080  transcriptional regulator, IclR family  25.73 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  27.14 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0349  IclR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000127041  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 270 aa  85.9  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184655 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  27.39 
 
 		 254 aa  85.5  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  29.35 
 
 		 278 aa  85.5  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2376  transcriptional regulator, IclR family  27.52 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157038  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  26.29 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  26.61 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3624  regulatory proteins, IclR  27.6 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3112  transcriptional regulator, IclR family  24.07 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5059  transcriptional regulator, IclR family  27.2 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.941275 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3621  transcriptional regulator, IclR family  24.8 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3913  transcriptional regulator, IclR family  26.34 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  24.9 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  26.69 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51530  multidrug efflux pump operon transcriptional regulator protein  28.23 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  23.48 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  29.13 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4402  regulatory proteins, IclR  21.97 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  25.98 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4375  transcriptional regulator, IclR family  26.57 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4105  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  26.2 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  26.94 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  26.8 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  24.49 
 
 		 264 aa  78.6  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 268 aa  78.6  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  26.29 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2718  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  27.8 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  26.32 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  28.81 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4215  transcriptional regulator, IclR family  27.19 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0022938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  25.58 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  23.39 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  25.7 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  24.51 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4891  IclR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4781  transcriptional regulator, IclR family  27.23 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  23.08 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4521  IclR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.948737 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2459  IclR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.383582  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  26.75 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  23.14 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  24.8 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  26.34 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2369  regulatory proteins, IclR  25.2 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>