More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2705 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2705  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 290 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6702  transcriptional regulator, IclR family  54.04 
 
 		 277 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.136407 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5802  transcriptional regulator, IclR family  56.13 
 
 		 277 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0468871 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5093  transcriptional regulator  56.63 
 
 		 275 aa  295  4e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2989  regulatory protein IclR  53.6 
 
 		 275 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4551  regulatory protein IclR  32.53 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0997  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 264 aa  142  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0970  IclR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 258 aa  142  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0939  IclR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2508  regulatory proteins, IclR  33.78 
 
 		 254 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.750932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3087  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0787215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6385  transcriptional regulator, IclR family  31.4 
 
 		 261 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.040112  normal  0.0189266 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2780  transcriptional regulator, IclR family  34.22 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3112  transcriptional regulator, IclR family  29.68 
 
 		 250 aa  112  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6681  IclR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.988544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 276 aa  92.4  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1534  regulatory protein, IclR  24.41 
 
 		 259 aa  89.4  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  23.89 
 
 		 257 aa  85.5  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  25.61 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4941  putative IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  25.39 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  26.02 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3699  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258779  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0134  IclR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.102301  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4375  transcriptional regulator, IclR family  27.08 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0585  IclR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal  0.0114736 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0617  IclR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  26.91 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  28.76 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  30 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  22.51 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  26.82 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  28.83 
 
 		 267 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0817  IclR family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.539423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  21.26 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2768  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  27.4 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1175  IclR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2490  IclR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1270  IclR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3490  IclR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3295  IclR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3452  IclR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880887  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5946  IclR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0410  IclR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.616756  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3489  transcriptional regulator  28.72 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  23.96 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  27.47 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0542  IclR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0393  transcriptional regulator, IclR family  29.76 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.701286  normal  0.393158 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4847  IclR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  23.6 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0041  IclR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  22.08 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4891  IclR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  23.53 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5102  transcriptional regulator, IclR family  27.31 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.500204  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  26.29 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0807  IclR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.190425 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  25.81 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  23.74 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3415  transcriptional regulator, IclR family  29.02 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257423  normal  0.172483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  28.51 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5394  IclR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.340198 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  24.42 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  27.59 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2201  IclR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5338  IclR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4749  IclR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5523  IclR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  24.8 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3687  transcriptional regulator, IclR family  23.11 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  25.56 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  21.63 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  26.8 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2981  transcriptional regulator, IclR family  26.84 
 
 		 285 aa  68.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 268 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2994  IclR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0847126  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  26.1 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1560  IclR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2619  IclR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471262  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>