More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0817 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0817  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 252 aa  521  1e-147  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.539423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0807  IclR family transcriptional regulator  95.63 
 
 		 252 aa  501  1e-141  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.190425 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1534  regulatory protein, IclR  60.41 
 
 		 259 aa  314  9e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4941  putative IclR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 301 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_004310  BR1639  IclR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 273 aa  153  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0495627  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1276  regulatory protein IclR  34.12 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1587  IclR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  24.7 
 
 		 258 aa  98.6  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  25.56 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 281 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  26.56 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  26.09 
 
 		 254 aa  93.6  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 272 aa  92.8  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  27.2 
 
 		 257 aa  92  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4375  transcriptional regulator, IclR family  27.15 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2718  transcriptional regulator, IclR family  26.99 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 254 aa  89.4  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 257 aa  88.6  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0484  IclR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 273 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0371471  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 246 aa  85.9  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  25 
 
 		 246 aa  85.9  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  25.54 
 
 		 254 aa  86.3  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  25.11 
 
 		 274 aa  85.5  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3913  transcriptional regulator, IclR family  24.5 
 
 		 262 aa  85.5  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  23.35 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  26.52 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  23.94 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  26.98 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  24.51 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4105  transcriptional regulator, IclR family  23.98 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  24.9 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4192  transcriptional regulator, IclR family  24.88 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5093  transcriptional regulator  23.08 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4080  transcriptional regulator, IclR family  24.88 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  27.71 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0997  IclR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2459  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.383582  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  28.81 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2092  transcriptional regulator, IclR family  27.45 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3127  IclR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4402  regulatory proteins, IclR  23.91 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  25.41 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  24.51 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  22.22 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  24.12 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  23.08 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0340  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04160  transcriptional regulator, IclR family  25.53 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0647577 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2705  transcriptional regulator, IclR family  23.05 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2402  IclR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0939  IclR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  24.8 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02174  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.4 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1410  transcriptional regulator, IclR family  25.4 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1401  IclR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.509968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2390  IclR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3389  transcriptional regulator, IclR family, C-terminal domain  25.4 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02133  hypothetical protein  25.4 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0724  transcriptional regulator, IclR family  24.21 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  22.83 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  22.36 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0217  transcriptional regulator, IclR family  26.32 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  24.7 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5946  IclR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5802  transcriptional regulator, IclR family  21.46 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0468871 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4215  transcriptional regulator, IclR family  27.31 
 
 		 258 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0022938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 550 aa  72  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  25.7 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4521  IclR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.948737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0876  IclR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3621  transcriptional regulator, IclR family  23.17 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2778  IclR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0655324  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  25.33 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  23.25 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1454  IclR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1420  transcriptional regulator, IclR family  25.37 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.956914 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2381  IclR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  22.27 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  20.63 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  26.36 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>