More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0997 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0997  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 264 aa  548  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0939  IclR family transcriptional regulator  99.24 
 
 		 264 aa  542  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6385  transcriptional regulator, IclR family  68.13 
 
 		 261 aa  364  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.040112  normal  0.0189266 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0970  IclR family transcriptional regulator  62.8 
 
 		 258 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4551  regulatory protein IclR  60.16 
 
 		 277 aa  311  6.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2508  regulatory proteins, IclR  54.07 
 
 		 254 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.750932  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2780  transcriptional regulator, IclR family  52.44 
 
 		 254 aa  268  7e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3087  IclR family transcriptional regulator  52.44 
 
 		 254 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0787215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3112  transcriptional regulator, IclR family  39.51 
 
 		 250 aa  195  7e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6681  IclR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.988544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2705  transcriptional regulator, IclR family  32.54 
 
 		 290 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2989  regulatory protein IclR  32.39 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6702  transcriptional regulator, IclR family  32.1 
 
 		 277 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.136407 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5093  transcriptional regulator  32.94 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5802  transcriptional regulator, IclR family  31.82 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0468871 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 272 aa  89  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  29.29 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  26.36 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  26.27 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0807  IclR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.190425 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  24.07 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0817  IclR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.539423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  23.75 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  25.53 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  26.51 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  23.98 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  23.48 
 
 		 252 aa  72  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4402  regulatory proteins, IclR  29.09 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  20.55 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  31.79 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  18.9 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  18.9 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  18.9 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  18.9 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  18.9 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  18.9 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  18.9 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  18.9 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  25.82 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  25.32 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  25.82 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  26.42 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2422  IclR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  19.35 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  23.83 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  23.05 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  18.9 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  18.9 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  18.9 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0697  IclR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.734635  decreased coverage  0.00216711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4376  transcriptional regulator, IclR family  28.9 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4994  transcriptional regulator, IclR family  32.41 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0276676  normal  0.0169874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  18.9 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  23.74 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  26.09 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  18.9 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2006  IclR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  25.85 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  27.44 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  23.83 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  30.28 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  23.14 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  23.14 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  23.14 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  23.14 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  23.14 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  23.14 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  31.54 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6106  IclR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.5704 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  23.14 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  23.94 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  25.42 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5822  IclR family transcriptional regulator  28 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  18.58 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1629  IclR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  24.34 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  24.88 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3802  IclR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  29.8 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2705  regulatory proteins, IclR  27.75 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  25.89 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4529  IclR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143169 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2285  transcriptional regulator, IclR family  27.11 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4269  IclR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0275811  normal  0.187391 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  26.34 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1534  regulatory protein, IclR  22.12 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  26.34 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>