More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2422 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2422  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  522  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0264  transcriptional regulator, IclR family  34.68 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00966775  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1022  IclR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.767316  normal  0.65898 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4369  IclR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 266 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 265 aa  89.7  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 254 aa  87.8  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  25.4 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  30.53 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  30.26 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  28.39 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4432  IclR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  26.02 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  31.05 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1930  IclR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1334  IclR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  30.43 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  29.78 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  30.2 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  29.02 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  28.25 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  29.38 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  32.32 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1344  IclR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.491684  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  29.8 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3112  transcriptional regulator, IclR family  26.63 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0462  regulatory proteins, IclR  28.88 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2285  transcriptional regulator, IclR family  31 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  24.4 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0378  IclR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105767  normal  0.274067 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3866  IclR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4080  transcriptional regulator, IclR family  28.87 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4192  transcriptional regulator, IclR family  28.87 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1621  IclR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706324  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1594  IclR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1646  IclR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 272 aa  72  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  29.9 
 
 		 260 aa  72  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6045  IclR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.820447 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  30.04 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  30.84 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2746  transcriptional regulator, IclR family  28.92 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.881679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  31.34 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3604  IclR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.83328  normal  0.323087 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  26.87 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6385  transcriptional regulator, IclR family  28.96 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.040112  normal  0.0189266 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  28.96 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  24.1 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 550 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  29.71 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2558  IclR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  27.78 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  24.62 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  25.63 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1499  IclR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985089  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0596  regulatory protein, IclR  29.32 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.691457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  24.89 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4402  regulatory proteins, IclR  28.07 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3673  transcriptional regulator, IclR family  31.44 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.146603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  27.92 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  28.97 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0997  IclR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0686  regulatory protein, IclR  29.77 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3497  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0939  IclR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.69 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3302  transcriptional regulator, IclR family  27.12 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3829  transcriptional regulator, IclR family  28.44 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1798  regulatory protein IclR  26.42 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2810  IclR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.162852  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  28.76 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2369  regulatory proteins, IclR  28.27 
 
 		 287 aa  67  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5574  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  31.12 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  30.2 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3872  regulatory protein, IclR  27.18 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.207868  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  31.77 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  24 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  30.83 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04160  transcriptional regulator, IclR family  27.56 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0647577 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  27.63 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>