More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7517 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 281 aa  564  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0759  transcriptional regulator, IclR family  49.61 
 
 		 259 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  48.4 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2092  transcriptional regulator, IclR family  48.3 
 
 		 270 aa  219  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321928 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  47.79 
 
 		 260 aa  216  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0484  IclR family transcriptional regulator  49.42 
 
 		 273 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0371471  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  48.5 
 
 		 260 aa  201  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 257 aa  199  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  43.27 
 
 		 266 aa  171  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  38.84 
 
 		 257 aa  146  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  31.87 
 
 		 252 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  36.09 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  34 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 272 aa  125  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  33.03 
 
 		 257 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  33.88 
 
 		 252 aa  123  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  34.77 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  31.35 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  32.81 
 
 		 257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 277 aa  112  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 260 aa  112  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  31.33 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  30.83 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  31.05 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  28.85 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  30.65 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  30.2 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  32.13 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  30.92 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5123  transcriptional regulator, IclR family  31.98 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  35.57 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  30.51 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  29.69 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  29.69 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  27.49 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  29.69 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  29.08 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  31.93 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  32.53 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  32.14 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1062  IclR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 255 aa  105  8e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 254 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  31.02 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1621  IclR family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706324  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1646  IclR family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1594  IclR family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  28.4 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  34.31 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2434  transcriptional regulator, IclR family  32.23 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0257982  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  35.89 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  30.52 
 
 		 254 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 319 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  27.64 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  32.1 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0906  regulatory proteins, IclR  32.74 
 
 		 254 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  31.97 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  29.12 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  30.74 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  34 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  33.6 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 278 aa  99.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4080  transcriptional regulator, IclR family  34.83 
 
 		 251 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  28.16 
 
 		 274 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 		 275 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4192  transcriptional regulator, IclR family  34.83 
 
 		 251 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  28.16 
 
 		 274 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  28.16 
 
 		 274 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  28.16 
 
 		 274 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  28.16 
 
 		 274 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 		 275 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  32.85 
 
 		 278 aa  99.4  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  29.51 
 
 		 277 aa  99.4  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4517  regulatory protein, IclR  31.15 
 
 		 255 aa  99  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530625  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0686  regulatory protein, IclR  30.84 
 
 		 266 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  29.92 
 
 		 248 aa  99  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4369  IclR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 266 aa  99  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3480  transcriptional regulator, IclR family  25.94 
 
 		 250 aa  98.6  9e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0462  regulatory proteins, IclR  29.55 
 
 		 268 aa  99  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  28.74 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0596  regulatory protein, IclR  28.73 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.691457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  32.03 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  31.98 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>