More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3480 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3480  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 250 aa  513  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  30.8 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  32.66 
 
 		 308 aa  126  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  28.77 
 
 		 256 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  29.82 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  25.31 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1062  IclR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  29.82 
 
 		 255 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  30.41 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  28.26 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  28.44 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1454  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  26.64 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  28.44 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  25.71 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0530  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  29.48 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 267 aa  109  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  29.09 
 
 		 281 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  27.06 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  27.4 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  27.06 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  26.91 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  26.16 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  27.62 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 275 aa  105  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  25.81 
 
 		 252 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  24.68 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  24.68 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  24.68 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  24.68 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  24.68 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  24.68 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  25.69 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  26.61 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  25.44 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  27.35 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  31.33 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  27.98 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  26.61 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0462  regulatory proteins, IclR  22.94 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  25.64 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  25.2 
 
 		 265 aa  99.4  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  24.18 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  24.18 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  26.15 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  24.18 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  24.18 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  24.18 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  25.69 
 
 		 257 aa  99.4  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  25.94 
 
 		 281 aa  98.6  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 264 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1621  IclR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 297 aa  98.6  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1646  IclR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 297 aa  98.6  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 263 aa  98.6  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1594  IclR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 297 aa  98.6  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 282 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  27.01 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0596  regulatory protein, IclR  23.14 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.691457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  22.13 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  29.22 
 
 		 266 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0686  regulatory protein, IclR  23.94 
 
 		 266 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  27.48 
 
 		 280 aa  95.9  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  26.58 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 283 aa  95.9  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 259 aa  95.5  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  26.43 
 
 		 251 aa  95.1  9e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2939  transcriptional regulator, IclR family  26.22 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  27.83 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 262 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 264 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  28.09 
 
 		 262 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  27.83 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  26.16 
 
 		 257 aa  93.6  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  23.05 
 
 		 254 aa  93.6  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  28.09 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 268 aa  93.6  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  25.57 
 
 		 271 aa  92.8  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  23.25 
 
 		 269 aa  92.8  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  27.03 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 262 aa  92.8  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3913  transcriptional regulator, IclR family  30.41 
 
 		 262 aa  92.8  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  21.72 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 275 aa  92.4  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  25.69 
 
 		 262 aa  92  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  24.41 
 
 		 265 aa  92  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  21.12 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  24.9 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 259 aa  90.5  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>