More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1018 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  100 
 
 
266 aa  534  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  54.85 
 
 
260 aa  231  7.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  52.24 
 
 
260 aa  228  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  52.65 
 
 
252 aa  227  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  52.82 
 
 
257 aa  225  7e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0759  transcriptional regulator, IclR family  47.64 
 
 
259 aa  178  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  43.27 
 
 
281 aa  171  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  44.4 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0484  IclR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0371471  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2092  transcriptional regulator, IclR family  42.17 
 
 
270 aa  159  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321928 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  37.84 
 
 
255 aa  132  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  34.5 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  40.18 
 
 
255 aa  129  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  31.75 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  35.57 
 
 
281 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  37.5 
 
 
261 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  37.55 
 
 
308 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  32.94 
 
 
261 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  34.57 
 
 
259 aa  123  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
284 aa  123  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
261 aa  123  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  34.36 
 
 
265 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  32.77 
 
 
257 aa  119  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  34.16 
 
 
276 aa  119  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  36.13 
 
 
277 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
260 aa  116  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  34.16 
 
 
277 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  27.31 
 
 
257 aa  115  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  34.45 
 
 
276 aa  115  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  30.52 
 
 
257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  34.15 
 
 
265 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  32.54 
 
 
254 aa  115  8.999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  34.03 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  34.03 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  31.1 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  38.25 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  29.92 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  34.03 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1062  IclR family transcriptional regulator  30.64 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  34.82 
 
 
258 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  32.77 
 
 
274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  32.37 
 
 
273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0456166 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  32.77 
 
 
274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  32.77 
 
 
274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  32.77 
 
 
274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  32.77 
 
 
274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  32.77 
 
 
274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
275 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  32.77 
 
 
274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  32.77 
 
 
274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  34.87 
 
 
277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  35.54 
 
 
257 aa  112  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  30.71 
 
 
260 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  37.62 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  31.35 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  32.79 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  30.71 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  33.99 
 
 
550 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  36 
 
 
248 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
267 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  31.63 
 
 
264 aa  107  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  29.67 
 
 
252 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
273 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  35.15 
 
 
261 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  31.43 
 
 
295 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  32.35 
 
 
274 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  32.35 
 
 
274 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  32.35 
 
 
274 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  32.35 
 
 
274 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  32.35 
 
 
274 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  30.08 
 
 
252 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0373  transcriptional regulator, IclR family  32.94 
 
 
274 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  32.61 
 
 
275 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  34.43 
 
 
251 aa  106  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
256 aa  106  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
258 aa  105  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  29.02 
 
 
253 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
260 aa  105  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  34.85 
 
 
242 aa  105  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5080  transcriptional regulator, IclR family  35.86 
 
 
249 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  30.08 
 
 
262 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  33.93 
 
 
255 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4080  transcriptional regulator, IclR family  33.61 
 
 
251 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361384  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  33.77 
 
 
277 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4192  transcriptional regulator, IclR family  33.61 
 
 
251 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2997  IclR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
275 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4901  IclR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
275 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182359  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5369  IclR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
275 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154296  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  32.31 
 
 
267 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  32.51 
 
 
265 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  31.3 
 
 
255 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  32.61 
 
 
254 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
257 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 
268 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
275 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  30.24 
 
 
263 aa  102  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
251 aa  102  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>