More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0373 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0373  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 
274 aa  561  1.0000000000000001e-159  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2443  transcriptional regulator, IclR family  48.19 
 
 
256 aa  217  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.627463  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  40.27 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
257 aa  119  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  35.5 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  34.65 
 
 
280 aa  115  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  33.62 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  32.46 
 
 
257 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  31.7 
 
 
257 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  34.15 
 
 
257 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  35.18 
 
 
260 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  33.59 
 
 
276 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  34.55 
 
 
254 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  32.94 
 
 
266 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  30.28 
 
 
256 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  35.25 
 
 
262 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  32.63 
 
 
252 aa  105  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  32.92 
 
 
252 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  35.02 
 
 
268 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  30.24 
 
 
261 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  36.65 
 
 
248 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  31.51 
 
 
254 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  34.76 
 
 
255 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  33.05 
 
 
252 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
256 aa  102  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27200  transcriptional regulator  34.68 
 
 
271 aa  101  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0677925  normal  0.469138 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  32.93 
 
 
271 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  32.92 
 
 
265 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  36.84 
 
 
308 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
259 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
252 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  35.02 
 
 
254 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  30.67 
 
 
275 aa  99.8  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
246 aa  99.4  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  27.94 
 
 
246 aa  99.4  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
264 aa  99  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  33.61 
 
 
257 aa  97.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  32.91 
 
 
255 aa  97.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6621  transcriptional regulator, IclR family  34.98 
 
 
273 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
262 aa  96.3  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3687  transcriptional regulator, IclR family  29.92 
 
 
272 aa  96.3  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  33.85 
 
 
246 aa  95.9  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  29.66 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  29.66 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  29.66 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  29.66 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0134  IclR family transcriptional regulator  30.9 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  29.66 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  29.66 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  29.66 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  29.66 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3884  transcriptional regulator, IclR family  29.92 
 
 
272 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  32.74 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5473  regulatory protein IclR  28.69 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  32.88 
 
 
257 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  33.64 
 
 
249 aa  94.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  29.39 
 
 
274 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  29.39 
 
 
274 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
254 aa  93.6  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  31.82 
 
 
248 aa  93.6  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  29.39 
 
 
274 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  32.58 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  29.39 
 
 
274 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  29.39 
 
 
274 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3948  transcriptional regulator, IclR family  31.8 
 
 
270 aa  93.2  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  34.67 
 
 
257 aa  92.8  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  31.91 
 
 
281 aa  92.4  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
273 aa  92  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4911  IclR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
276 aa  92  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406508  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  30.2 
 
 
286 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2939  transcriptional regulator, IclR family  31.67 
 
 
269 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  31.6 
 
 
265 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  30.64 
 
 
277 aa  91.3  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4675  transcriptional regulator, IclR family  34.03 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236119  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  30.21 
 
 
280 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  30.21 
 
 
280 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  31.97 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  32.72 
 
 
264 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
275 aa  90.5  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  29.53 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  30.21 
 
 
280 aa  91.3  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2181  transcriptional regulator, IclR family  32.47 
 
 
269 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169308  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
269 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  33 
 
 
284 aa  90.1  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3945  HTH-type transcriptional regulator YiaJ  30.77 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  31.33 
 
 
277 aa  90.1  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3865  HTH-type transcriptional regulator  30.77 
 
 
266 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  32.74 
 
 
258 aa  90.1  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  30.47 
 
 
276 aa  90.1  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4071  IclR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
270 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  32.44 
 
 
265 aa  89.4  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  29.56 
 
 
253 aa  89.4  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  34.05 
 
 
550 aa  89.7  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0504  transcriptional regulator, IclR family  30.2 
 
 
266 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3778  IclR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
270 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1991  regulatory proteins, IclR  32.9 
 
 
269 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0527624  normal  0.0427076 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
257 aa  89.4  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  31.3 
 
 
252 aa  89.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>