More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0504 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0504  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 266 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  89.06 
 
 		 265 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  58.05 
 
 		 286 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  39.84 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  41.25 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  40 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  34.17 
 
 		 260 aa  158  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  34.26 
 
 		 259 aa  152  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  32.51 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  30.98 
 
 		 278 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  29.88 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3341  IclR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 277 aa  139  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 272 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  36.96 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  31.22 
 
 		 252 aa  136  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  31 
 
 		 246 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  31 
 
 		 246 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.84 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  31.84 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  31.84 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  31.84 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  31.84 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  31.84 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  31.84 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  32.86 
 
 		 252 aa  129  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  33.33 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  31.84 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  31.84 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  31.84 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.46 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  31.84 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  31.84 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0198  Transcriptional regulator IclR  36.6 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101079  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  31.82 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  30.94 
 
 		 263 aa  125  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  32.37 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 267 aa  125  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  33.49 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 276 aa  123  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 268 aa  122  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  30.94 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  30.94 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  30.49 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0724  transcriptional regulator, IclR family  36.63 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  30.94 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  31.96 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  30.45 
 
 		 260 aa  119  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 280 aa  118  7.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 254 aa  118  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  30.13 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  30.13 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  32.69 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  34.02 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  32.29 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 273 aa  117  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 258 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  32.88 
 
 		 249 aa  115  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  29.52 
 
 		 295 aa  115  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  30.46 
 
 		 265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1062  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  31.47 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  29.78 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 550 aa  113  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  29.03 
 
 		 257 aa  112  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0800  transcriptional regulator  32.07 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  32.51 
 
 		 257 aa  112  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  34.8 
 
 		 299 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  34.47 
 
 		 257 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  30.5 
 
 		 290 aa  112  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  32.88 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  31.7 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  32.55 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  29.33 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  32.88 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5123  transcriptional regulator, IclR family  32.91 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  36 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  31.82 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  31.82 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  31.82 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 286 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  32.91 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  32.02 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>