More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3341 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3341  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 277 aa  553  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2718  transcriptional regulator, IclR family  52 
 
 		 265 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  36.73 
 
 		 265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  33.06 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  36.29 
 
 		 262 aa  136  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  33.75 
 
 		 252 aa  135  9e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  34.69 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 269 aa  132  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0504  transcriptional regulator, IclR family  35.18 
 
 		 266 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2434  transcriptional regulator, IclR family  34.77 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0257982  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  28.86 
 
 		 256 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  29.92 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  35.56 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  36.11 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  31.67 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  34.48 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  34.68 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.63 
 
 		 569 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0800  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  33.64 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  31.43 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  29.1 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  29.8 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 550 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  28.98 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6028  transcriptional regulator, IclR family  33.62 
 
 		 546 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0187184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 261 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  32.03 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2981  transcriptional regulator, IclR family  32.48 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  34.09 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  34.67 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  29.8 
 
 		 263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  35.51 
 
 		 249 aa  113  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  35.94 
 
 		 246 aa  112  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  28.98 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.8 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  29.8 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  35.87 
 
 		 257 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  29.8 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  29.8 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  29.8 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  29.8 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  29.8 
 
 		 263 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  37.9 
 
 		 296 aa  112  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  33.64 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  31.05 
 
 		 254 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  29.46 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 263 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  28.98 
 
 		 263 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  28.98 
 
 		 263 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  31.62 
 
 		 257 aa  108  8.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  28.24 
 
 		 274 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  28.24 
 
 		 274 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  28.24 
 
 		 274 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  33.62 
 
 		 276 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  28.24 
 
 		 274 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  28.24 
 
 		 274 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  28.24 
 
 		 274 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  28.24 
 
 		 274 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  28.24 
 
 		 274 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  29.44 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  28.98 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  28.98 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  36.95 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  28.98 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  28.98 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  28.98 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5123  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  27.48 
 
 		 294 aa  106  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  35.48 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  32.79 
 
 		 251 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  34.83 
 
 		 248 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  32.79 
 
 		 251 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 267 aa  106  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  32.79 
 
 		 251 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  32.79 
 
 		 251 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  30.37 
 
 		 279 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  28.09 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  30 
 
 		 266 aa  105  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  31.43 
 
 		 281 aa  105  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  31.44 
 
 		 277 aa  105  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 284 aa  105  9e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>