More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B3734 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  100 
 
 
251 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  100 
 
 
251 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  100 
 
 
251 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  100 
 
 
251 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  41.81 
 
 
269 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3913  transcriptional regulator, IclR family  40.42 
 
 
262 aa  178  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4105  transcriptional regulator, IclR family  40 
 
 
262 aa  175  7e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02174  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.8 
 
 
260 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1410  transcriptional regulator, IclR family  38.8 
 
 
260 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02133  hypothetical protein  38.8 
 
 
260 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1401  IclR family transcriptional regulator  38.8 
 
 
260 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.509968  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2390  IclR family transcriptional regulator  38.8 
 
 
260 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2402  IclR family transcriptional regulator  39.2 
 
 
260 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3389  transcriptional regulator, IclR family, C-terminal domain  38.4 
 
 
260 aa  166  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2532  putative transcriptional regulator  36.4 
 
 
260 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.221562  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2477  putative transcriptional regulator  36 
 
 
259 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245965  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2428  putative transcriptional regulator  36 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2520  putative transcriptional regulator  36 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2636  putative transcriptional regulator  36 
 
 
260 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.982011 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3701  transcriptional regulator, IclR family  35.74 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  38.84 
 
 
252 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  30.77 
 
 
295 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  38.84 
 
 
252 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  34.43 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  31.15 
 
 
277 aa  137  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  34.52 
 
 
263 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  33.92 
 
 
256 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  34.52 
 
 
263 aa  135  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 
263 aa  134  9e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  36.07 
 
 
253 aa  135  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  32.23 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  30.08 
 
 
273 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  31.97 
 
 
259 aa  133  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
263 aa  132  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  34.13 
 
 
263 aa  132  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  34.13 
 
 
263 aa  132  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  34.76 
 
 
255 aa  132  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 
263 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  33.33 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  33.33 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  33.33 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
272 aa  130  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  33.33 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  33.33 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  33.33 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  33.33 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  33.78 
 
 
261 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  27.71 
 
 
273 aa  129  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
267 aa  129  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  38.57 
 
 
258 aa  128  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  30.29 
 
 
246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0430  IclR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0855586  normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  30.74 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  30.49 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  38.02 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  30.49 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  35.75 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  30.74 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  32.29 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  31.53 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
254 aa  125  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  34.4 
 
 
246 aa  125  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  32.14 
 
 
263 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  32.14 
 
 
263 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  32.14 
 
 
263 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  32.14 
 
 
263 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  32.14 
 
 
263 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  39.45 
 
 
255 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5123  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 
255 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
292 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  35.1 
 
 
281 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 
284 aa  122  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  32.9 
 
 
290 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  35.1 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  28.92 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  29.72 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  28.92 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  28.92 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  28.92 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  29.72 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  29.72 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  28.92 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  32.38 
 
 
278 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  35.2 
 
 
308 aa  119  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  30.4 
 
 
287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  34.21 
 
 
264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  32.74 
 
 
254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  30.24 
 
 
265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
276 aa  119  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  28.23 
 
 
274 aa  118  7e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>