More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3524 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 
296 aa  586  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  45.6 
 
 
299 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  48.85 
 
 
276 aa  192  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  48.43 
 
 
324 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  48.43 
 
 
308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  48.43 
 
 
286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  41.7 
 
 
253 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  38.4 
 
 
246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  37.65 
 
 
252 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  39.73 
 
 
264 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  38.6 
 
 
267 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  34.35 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
249 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
249 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3341  IclR family transcriptional regulator  37.9 
 
 
277 aa  112  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  33.66 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  34.66 
 
 
258 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5822  IclR family transcriptional regulator  36.24 
 
 
294 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  36.86 
 
 
270 aa  109  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  34.29 
 
 
259 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  34.51 
 
 
264 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  37.38 
 
 
277 aa  108  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
268 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  35.52 
 
 
266 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  36.36 
 
 
260 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  39.68 
 
 
255 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0759  transcriptional regulator, IclR family  36.65 
 
 
259 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  33.49 
 
 
252 aa  105  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  36.23 
 
 
267 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  34.31 
 
 
281 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  32.83 
 
 
238 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  37.08 
 
 
254 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  35.47 
 
 
249 aa  102  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2532  putative transcriptional regulator  34.72 
 
 
260 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.221562  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02174  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.76 
 
 
260 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1410  transcriptional regulator, IclR family  33.76 
 
 
260 aa  102  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  32.88 
 
 
252 aa  102  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2390  IclR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
260 aa  102  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02133  hypothetical protein  33.76 
 
 
260 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1401  IclR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
260 aa  102  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.509968  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2428  putative transcriptional regulator  34.26 
 
 
260 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2402  IclR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
260 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2477  putative transcriptional regulator  34.26 
 
 
259 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245965  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2520  putative transcriptional regulator  34.26 
 
 
260 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  38.12 
 
 
260 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4192  transcriptional regulator, IclR family  40 
 
 
251 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  36.77 
 
 
268 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  36.32 
 
 
265 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3389  transcriptional regulator, IclR family, C-terminal domain  33.33 
 
 
260 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2636  putative transcriptional regulator  34.72 
 
 
260 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4080  transcriptional regulator, IclR family  40 
 
 
251 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361384  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
269 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
269 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  31.17 
 
 
251 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
269 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  31.17 
 
 
251 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  31.17 
 
 
251 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
269 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  31.17 
 
 
251 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
268 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
269 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
269 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  36.32 
 
 
268 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15210  transcriptional regulator  38.62 
 
 
257 aa  99.8  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
264 aa  99.4  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
269 aa  99  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  33.46 
 
 
262 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
270 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
270 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
259 aa  98.6  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
270 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  35.9 
 
 
234 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  35.9 
 
 
234 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1081  transcriptional regulator, IclR family  36.49 
 
 
259 aa  98.6  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199562  normal  0.251697 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  35.9 
 
 
234 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
270 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
270 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  35.29 
 
 
242 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  34.63 
 
 
261 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  36.11 
 
 
270 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
270 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
270 aa  98.2  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
263 aa  97.8  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  29.83 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  32.65 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5080  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 
249 aa  97.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
271 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3913  transcriptional regulator, IclR family  31.37 
 
 
262 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  36.94 
 
 
251 aa  97.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
269 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  32.52 
 
 
259 aa  96.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3624  regulatory proteins, IclR  32.14 
 
 
286 aa  96.7  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  35.5 
 
 
261 aa  96.3  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  31.41 
 
 
283 aa  96.7  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3937  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 
267 aa  95.9  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.793317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  35.68 
 
 
247 aa  95.9  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  34.17 
 
 
253 aa  95.5  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4105  transcriptional regulator, IclR family  30.39 
 
 
262 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>