More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0559 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 249 aa  496  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  97.44 
 
 		 234 aa  437  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  97.44 
 
 		 234 aa  437  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  97.44 
 
 		 234 aa  437  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0531  regulatory protein, IclR  98.14 
 
 		 215 aa  420  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  56.75 
 
 		 259 aa  255  5e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  53.82 
 
 		 248 aa  245  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  49.6 
 
 		 270 aa  226  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  49.79 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  48.58 
 
 		 254 aa  210  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1725  IclR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 279 aa  176  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200124  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 264 aa  175  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1697  regulatory proteins, IclR  98.89 
 
 		 90 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  42.21 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  44.63 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  40.95 
 
 		 252 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4896  transcriptional regulator, IclR family  39.67 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2285  transcriptional regulator  34.96 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  41.25 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15210  transcriptional regulator  39.17 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4100  IclR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  33.63 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 272 aa  125  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0434  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 		 284 aa  125  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  37.25 
 
 		 253 aa  125  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3424  transcriptional regulator, IclR family  35.25 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  36.07 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3485  IclR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 276 aa  123  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  40.09 
 
 		 264 aa  122  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  34.3 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  32.29 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1008  regulatory proteins, IclR  55.26 
 
 		 133 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0609886  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  34.39 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4044  IclR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  31.8 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3839  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 247 aa  112  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4088  transcriptional regulator, IclR family  33.6 
 
 		 275 aa  112  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.855439  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  34.82 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  36.02 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  30.73 
 
 		 252 aa  109  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  28.23 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  32.32 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  31.23 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  35.58 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  33.8 
 
 		 268 aa  105  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  34.86 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2388  transcriptional regulator, IclR family  34 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000136805  decreased coverage  0.000110172 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  34.82 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  32.33 
 
 		 255 aa  102  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  30.83 
 
 		 261 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 263 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 263 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 263 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  30.28 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  34.18 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  29.58 
 
 		 259 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  29.34 
 
 		 259 aa  99.8  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 276 aa  99.8  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  30.29 
 
 		 266 aa  99.4  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 262 aa  99  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 257 aa  99  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 246 aa  99  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  28.96 
 
 		 246 aa  99  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  34.27 
 
 		 265 aa  98.6  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  34.9 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  31.67 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  29.44 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4860  IclR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  30.3 
 
 		 268 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0541  transcriptional regulator, IclR family  31.49 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.765211  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  30.26 
 
 		 254 aa  96.3  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 268 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 268 aa  95.5  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 268 aa  95.5  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 269 aa  95.5  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  31.86 
 
 		 284 aa  95.5  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  32.02 
 
 		 271 aa  95.1  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  31.34 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0504  transcriptional regulator, IclR family  31.84 
 
 		 266 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1776  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>