81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1697 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1697  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 90 aa  177  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  98.89 
 
 		 249 aa  175  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  98.89 
 
 		 234 aa  174  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  98.89 
 
 		 234 aa  174  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  98.89 
 
 		 234 aa  174  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0531  regulatory protein, IclR  98.89 
 
 		 215 aa  174  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  47.13 
 
 		 253 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1008  regulatory proteins, IclR  50 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0609886  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  51.14 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  47.62 
 
 		 248 aa  68.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  44.44 
 
 		 254 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  43.02 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 264 aa  52.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3996  IclR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 256 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  38.37 
 
 		 252 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 270 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 249 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 249 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  36.36 
 
 		 254 aa  50.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5069  transcriptional regulator, IclR family  37.14 
 
 		 251 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.469933  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 250 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  37.93 
 
 		 267 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 257 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 250 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1725  IclR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 279 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200124  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  39.44 
 
 		 266 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  39.44 
 
 		 266 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  34.33 
 
 		 258 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 258 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1951  transcriptional regulator, IclR family  35.29 
 
 		 261 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  32.39 
 
 		 257 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  38.89 
 
 		 268 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  32.39 
 
 		 257 aa  47  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4100  IclR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 239 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 263 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  30.99 
 
 		 277 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1587  transcriptional regulator, IclR family  35.59 
 
 		 835 aa  45.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0088004 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 261 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  36 
 
 		 259 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2388  transcriptional regulator, IclR family  36.05 
 
 		 267 aa  44.3  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000136805  decreased coverage  0.000110172 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 		 242 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0601  putative transcriptional regulator PcaR  39.66 
 
 		 256 aa  44.3  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0639  transcriptional regulator PcaR, putative  39.66 
 
 		 256 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  39.68 
 
 		 264 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3829  transcriptional regulator, IclR family  35.53 
 
 		 264 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  29.41 
 
 		 263 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6149  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 261 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.508102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  31.94 
 
 		 259 aa  43.5  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 269 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3604  IclR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 253 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.83328  normal  0.323087 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  36.54 
 
 		 246 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  40 
 
 		 266 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 		 267 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  35.96 
 
 		 251 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  35.96 
 
 		 251 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  35.96 
 
 		 251 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  35.96 
 
 		 251 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  32.14 
 
 		 256 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1070  regulatory proteins, IclR  39.44 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 272 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2985  regulatory proteins, IclR  34.83 
 
 		 516 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5126  transcriptional regulator, IclR family  36.17 
 
 		 255 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  34.72 
 
 		 262 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5886  transcriptional regulator, IclR family  35.94 
 
 		 252 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6800  transcriptional regulator, IclR family  34.38 
 
 		 252 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 259 aa  41.2  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6222  IclR family transcriptional regulator  32 
 
 		 269 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  28.24 
 
 		 263 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0800  transcriptional regulator  31.11 
 
 		 260 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  31.17 
 
 		 265 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2285  transcriptional regulator  34.88 
 
 		 261 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19700  transcriptional regulator, IclR family  33.8 
 
 		 272 aa  40.8  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.089385  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2252  transcriptional regulator, IclR family  35.82 
 
 		 263 aa  40.8  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  33.8 
 
 		 263 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1370  transcriptional regulator IclR-like protein  31.46 
 
 		 512 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874129  normal  0.612031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 238 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  29.41 
 
 		 263 aa  40.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0687  regulatory proteins, IclR  35.48 
 
 		 263 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 263 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 263 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 263 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>