More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6149 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6149  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 261 aa  531  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.508102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4954  transcriptional regulator, IclR family  66.54 
 
 		 265 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1070  regulatory proteins, IclR  63.55 
 
 		 205 aa  264  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 250 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3350  transcriptional regulator IclR  33.47 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 250 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4595  IclR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4375  transcriptional regulator, IclR family  32.79 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  31.5 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0417  IclR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 252 aa  135  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0284942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13880  transcriptional regulatory protein, IclR family  32.93 
 
 		 267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176969  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6219  IclR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 254 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4381  transcriptional regulator, IclR family  31.67 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4521  IclR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.948737 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0700  IclR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456524  decreased coverage  0.00240678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  31.62 
 
 		 254 aa  125  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4215  transcriptional regulator, IclR family  31.37 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0022938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  27.38 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  31.28 
 
 		 294 aa  122  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0800  transcriptional regulator  31.09 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1433  IclR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5946  IclR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  31.28 
 
 		 278 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4529  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143169 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2006  IclR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1512  IclR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.388908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  30.87 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0697  IclR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.734635  decreased coverage  0.00216711 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6222  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  31.62 
 
 		 277 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4376  transcriptional regulator, IclR family  32.1 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1785  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0905  IclR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 252 aa  109  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.818194  normal  0.447729 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  27.2 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  32.22 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  32.48 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 280 aa  105  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  29.1 
 
 		 259 aa  105  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  31.74 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  29.6 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0296  transcriptional regulator IclR-like protein  26.61 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 282 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  31.3 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  30.63 
 
 		 248 aa  102  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  27.31 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27.9 
 
 		 256 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  27.08 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 269 aa  99.8  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  26.64 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 262 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  31.42 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 291 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  31.22 
 
 		 258 aa  97.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  32.27 
 
 		 249 aa  97.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 550 aa  96.7  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 258 aa  95.9  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  26.86 
 
 		 252 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  29.1 
 
 		 295 aa  95.9  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  27.27 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 283 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  31.67 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  32.52 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 284 aa  94  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  31.67 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  26.27 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  28.11 
 
 		 281 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  27.78 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3341  IclR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 277 aa  92.8  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19700  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 272 aa  92.4  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.089385  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 261 aa  92  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 268 aa  92  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 277 aa  91.3  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  25.83 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  29.15 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  27.42 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  26.12 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  26.69 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5069  transcriptional regulator, IclR family  31.22 
 
 		 251 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.469933  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  26.89 
 
 		 280 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 264 aa  89.7  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  24.78 
 
 		 274 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  24.78 
 
 		 274 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  24.78 
 
 		 274 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  30.99 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  24.78 
 
 		 274 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  24.78 
 
 		 274 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  24.78 
 
 		 274 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  24.78 
 
 		 274 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  24.78 
 
 		 274 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6262  IclR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 260 aa  89.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>