More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5946 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5946  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  531  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  55.61 
 
 		 271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4375  transcriptional regulator, IclR family  42.68 
 
 		 250 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  44.21 
 
 		 254 aa  192  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  42.56 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4529  IclR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143169 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2006  IclR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 274 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 250 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4215  transcriptional regulator, IclR family  42.06 
 
 		 258 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0022938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6222  IclR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 269 aa  174  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6219  IclR family transcriptional regulator  40 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0697  IclR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 293 aa  171  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.734635  decreased coverage  0.00216711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4376  transcriptional regulator, IclR family  44 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  38.17 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4381  transcriptional regulator, IclR family  38.37 
 
 		 254 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0700  IclR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456524  decreased coverage  0.00240678 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4521  IclR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.948737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  40 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0417  IclR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 252 aa  158  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0284942  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1433  IclR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 255 aa  158  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4595  IclR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  38.74 
 
 		 294 aa  152  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0800  transcriptional regulator  39.08 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  39.83 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13880  transcriptional regulatory protein, IclR family  35.86 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176969  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  39.3 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4954  transcriptional regulator, IclR family  35.95 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3350  transcriptional regulator IclR  32.27 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1512  IclR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.388908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0905  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.818194  normal  0.447729 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0296  transcriptional regulator IclR-like protein  31.12 
 
 		 252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1785  IclR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6149  IclR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.508102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  33.05 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  35.32 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 267 aa  116  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0198  Transcriptional regulator IclR  35.4 
 
 		 265 aa  116  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101079  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  28.69 
 
 		 246 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 246 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 260 aa  115  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  32.2 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 264 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  32.26 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  33.2 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  31.06 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  31.9 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  29.55 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  32.68 
 
 		 277 aa  105  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  26.21 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  29.55 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  30.7 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1070  regulatory proteins, IclR  31.41 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2778  IclR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 253 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0655324  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  28.99 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  28.99 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  28.99 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 272 aa  102  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  30.56 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6121  transcriptional regulator IclR family  33.67 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  35.27 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  28.26 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  30.84 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  31.95 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0480  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.4 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3768  IclR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0382  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.4 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1491  IclR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 285 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1811  IclR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 285 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 273 aa  99.4  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0797  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.4 
 
 		 261 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  31.34 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2114  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.4 
 
 		 261 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.247685  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  33.83 
 
 		 268 aa  99  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  27.1 
 
 		 254 aa  99  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 319 aa  98.6  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  30.28 
 
 		 280 aa  97.8  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  26.02 
 
 		 267 aa  98.6  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  30.38 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  35.29 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3950  IclR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000408149  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  26.14 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  29.03 
 
 		 280 aa  97.1  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  35.29 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4893  transcriptional regulator, IclR family  31.67 
 
 		 549 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>