More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3950 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3950  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 267 aa  549  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000408149  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 263 aa  116  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  29.58 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2670  transcriptional regulator, IclR family  27.83 
 
 		 252 aa  112  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  28.16 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  32.78 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  29.17 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  30.2 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.62 
 
 		 569 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0198  Transcriptional regulator IclR  33.18 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101079  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  27.2 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.53 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  33.82 
 
 		 255 aa  99  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 252 aa  99  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  29.46 
 
 		 254 aa  98.6  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 264 aa  98.6  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  29.17 
 
 		 254 aa  98.6  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5946  IclR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  25.83 
 
 		 257 aa  96.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 277 aa  96.3  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  32.16 
 
 		 275 aa  95.9  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 260 aa  95.1  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  30.42 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  26.23 
 
 		 256 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  26.64 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  24.79 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  28.64 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  31.05 
 
 		 271 aa  94  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  25.49 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4595  IclR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 257 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  25.88 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 262 aa  92.4  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 260 aa  92  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 264 aa  92  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1433  IclR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 255 aa  92  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  28.5 
 
 		 265 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  26.82 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 292 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  26.64 
 
 		 261 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3479  regulatory proteins, IclR  29.26 
 
 		 251 aa  90.5  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0476526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 263 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  28.4 
 
 		 257 aa  90.1  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  29.35 
 
 		 278 aa  89.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0800  transcriptional regulator  27.97 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  31.88 
 
 		 265 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  26.94 
 
 		 255 aa  89.4  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2367  IclR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 253 aa  89  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.054523  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  30 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2006  IclR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0162  transcriptional regulator, IclR family  29.74 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  29.39 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  27.71 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0504  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  26.01 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 		 281 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  26.43 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4432  IclR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 246 aa  87  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5126  transcriptional regulator, IclR family  29.46 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  25 
 
 		 246 aa  87  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4376  transcriptional regulator, IclR family  29.81 
 
 		 278 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 550 aa  87  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02174  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.67 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1401  IclR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.509968  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1410  transcriptional regulator, IclR family  27.67 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2390  IclR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 249 aa  86.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2402  IclR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  27.07 
 
 		 280 aa  86.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02133  hypothetical protein  27.67 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 250 aa  86.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  26.36 
 
 		 265 aa  86.3  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  26.47 
 
 		 267 aa  86.3  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  28.12 
 
 		 266 aa  85.9  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3341  IclR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 277 aa  85.9  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13880  transcriptional regulatory protein, IclR family  25.98 
 
 		 267 aa  85.9  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176969  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 275 aa  85.9  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  27 
 
 		 254 aa  85.9  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 264 aa  85.5  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  26.91 
 
 		 251 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  26.91 
 
 		 251 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  26.91 
 
 		 251 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  26.91 
 
 		 251 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>