More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0162 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0162  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 257 aa  526  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4574  IclR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0696248  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 		 275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0866  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0543323  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  32.3 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.48 
 
 		 252 aa  105  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  29.53 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  31.22 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  28.45 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  28.87 
 
 		 253 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  30.16 
 
 		 265 aa  101  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.96 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  29.96 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  29.96 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  29.96 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  29.96 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  29.96 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  29.96 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  29.3 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.14 
 
 		 280 aa  99.4  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0607  IclR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 280 aa  99  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171658  normal  0.119354 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  29.64 
 
 		 252 aa  98.6  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3687  transcriptional regulator, IclR family  28.82 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3884  transcriptional regulator, IclR family  28.38 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  30.52 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  32.77 
 
 		 249 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 272 aa  97.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 272 aa  97.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  29.18 
 
 		 263 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  29.18 
 
 		 263 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  29.18 
 
 		 263 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  29.18 
 
 		 263 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  29.18 
 
 		 263 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 292 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1057  transcriptional regulator, IclR family  29.07 
 
 		 282 aa  95.5  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  28.52 
 
 		 263 aa  95.5  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5250  IclR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 254 aa  95.5  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  29.44 
 
 		 290 aa  95.1  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 276 aa  95.1  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2670  transcriptional regulator, IclR family  27.67 
 
 		 252 aa  94.4  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.97 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  30.7 
 
 		 257 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  35.14 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4608  IclR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249268  normal  0.348784 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3945  HTH-type transcriptional regulator YiaJ  28.45 
 
 		 266 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4071  IclR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3296  IclR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 250 aa  93.2  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  28.46 
 
 		 252 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4172  transcriptional regulator, IclR family  32.32 
 
 		 249 aa  92.4  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102148  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0496  regulatory protein, IclR  32.21 
 
 		 287 aa  92.4  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1882  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 274 aa  92  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.201982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3881  hth-type tranScriptional regulator yiaj  28.02 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3990  hth-type tranScriptional regulator yiaj  28.02 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.776659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  27.73 
 
 		 263 aa  91.3  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3865  HTH-type transcriptional regulator  28.02 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  26.88 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3778  IclR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 270 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4051  HTH-type transcriptional regulator YiaJ  28.02 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.726111 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0136  transcriptional regulator, IclR family  28.76 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3948  transcriptional regulator, IclR family  28.76 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0140  IclR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3897  IclR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  32.29 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  27.76 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03426  predicted DNA-binding transcriptional repressor  28.76 
 
 		 282 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3965  IclR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 264 aa  89.7  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03377  hypothetical protein  28.76 
 
 		 282 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 256 aa  89.7  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  26.69 
 
 		 265 aa  89.4  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  30.5 
 
 		 278 aa  89  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  30.98 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5126  transcriptional regulator, IclR family  31 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3950  IclR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000408149  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  26.95 
 
 		 263 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0349  IclR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 265 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000127041  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0134  IclR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 268 aa  87  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272177  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0516  transcriptional regulator, IclR family  28.82 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4689  transcriptional regulator, IclR family  31.09 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 276 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 291 aa  87  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  28.38 
 
 		 308 aa  86.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  28.85 
 
 		 264 aa  87  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  27.34 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 268 aa  87  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2099  IclR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.734801  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 268 aa  86.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  28.08 
 
 		 257 aa  86.7  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  30.86 
 
 		 277 aa  86.3  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 261 aa  85.9  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 267 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  33.16 
 
 		 276 aa  85.5  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 269 aa  85.5  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>