More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3965 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3965  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 264 aa  541  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0134  IclR family transcriptional regulator  64.06 
 
 		 268 aa  347  2e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272177  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  38.91 
 
 		 278 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  39.77 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  39.77 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 285 aa  194  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1497  IclR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 286 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 285 aa  188  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  38.46 
 
 		 324 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 310 aa  185  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 324 aa  185  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  38.08 
 
 		 294 aa  185  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 294 aa  184  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 285 aa  184  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 298 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 298 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 316 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 298 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 316 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 314 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 318 aa  178  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6032  IclR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 268 aa  165  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  28.11 
 
 		 252 aa  136  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  32.77 
 
 		 308 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3476  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  33.96 
 
 		 284 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5886  transcriptional regulator, IclR family  30.84 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  30.17 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3600  regulatory protein, IclR  31.25 
 
 		 278 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633228  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  31.22 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28.23 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6800  transcriptional regulator, IclR family  30.3 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  29.44 
 
 		 291 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  29.44 
 
 		 291 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  25.91 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 319 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6262  IclR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  32.29 
 
 		 274 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4070  IclR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 274 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 274 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  29.8 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5288  regulatory protein, IclR  28.11 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.497587 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  30.61 
 
 		 267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  28.46 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0480  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.9 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0382  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.9 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 271 aa  108  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  28.57 
 
 		 280 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1491  IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1811  IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  30.36 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  30.41 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  27.42 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0797  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.43 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0639  transcriptional regulator PcaR, putative  29 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  29.2 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2114  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.43 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.247685  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2127  IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  28.8 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4014  regulatory proteins, IclR  28.57 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  29.41 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  27.73 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8459  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 266 aa  106  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  25.61 
 
 		 257 aa  106  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>