More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA1340 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 316 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 316 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 316 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 316 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  99.37 
 
 		 316 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  99.37 
 
 		 316 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  99.05 
 
 		 316 aa  617  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  94.3 
 
 		 316 aa  541  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  83.39 
 
 		 314 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  83.07 
 
 		 314 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  84.79 
 
 		 310 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  90.39 
 
 		 297 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  88.15 
 
 		 298 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  82.33 
 
 		 298 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  82.33 
 
 		 298 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  70.62 
 
 		 324 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  71.15 
 
 		 318 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  69.06 
 
 		 324 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  66.3 
 
 		 294 aa  359  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  66.54 
 
 		 286 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  64.42 
 
 		 294 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 284 aa  346  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  64.44 
 
 		 285 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  64.96 
 
 		 284 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  64.96 
 
 		 284 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  64.96 
 
 		 284 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  64.96 
 
 		 284 aa  342  5e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  64.96 
 
 		 284 aa  342  5e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  64.96 
 
 		 284 aa  342  5e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  64.96 
 
 		 284 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  63.7 
 
 		 285 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  63.7 
 
 		 285 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  63.7 
 
 		 285 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1497  IclR family transcriptional regulator  64.23 
 
 		 284 aa  338  8e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  63 
 
 		 285 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  62.96 
 
 		 285 aa  335  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6032  IclR family transcriptional regulator  56.03 
 
 		 279 aa  289  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  54.26 
 
 		 275 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  54.26 
 
 		 275 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  58.04 
 
 		 285 aa  265  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  56.47 
 
 		 274 aa  265  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  54.26 
 
 		 278 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  52.87 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 295 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0134  IclR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272177  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3965  IclR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  42 
 
 		 268 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3476  IclR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 276 aa  142  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  37.61 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 267 aa  134  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 254 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  32.27 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  28.08 
 
 		 260 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  34.08 
 
 		 263 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 260 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  28.19 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 260 aa  119  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 260 aa  119  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  32.55 
 
 		 253 aa  119  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  32.59 
 
 		 267 aa  119  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  27.8 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 275 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  27.8 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  35.83 
 
 		 274 aa  116  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 267 aa  116  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 275 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  29.69 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  31.5 
 
 		 267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  34.78 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3600  regulatory protein, IclR  33.09 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633228  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  30.31 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  31.76 
 
 		 277 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  31.78 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  29.53 
 
 		 265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4901  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5369  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2997  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 272 aa  112  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 261 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  32.2 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2127  IclR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  31.48 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  31.88 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0382  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.96 
 
 		 261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0480  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.96 
 
 		 261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  27.02 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1436  IclR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.580243 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4406  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.41646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>