More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0134 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0134  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
268 aa  538  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272177  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3965  IclR family transcriptional regulator  64.06 
 
 
264 aa  347  2e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  40.08 
 
 
275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  40.08 
 
 
275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
294 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  42.91 
 
 
284 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  42.91 
 
 
284 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  42.91 
 
 
284 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  42.91 
 
 
284 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  42.91 
 
 
284 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  42.46 
 
 
284 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  41.38 
 
 
324 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  42.91 
 
 
284 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  42.91 
 
 
284 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  40.48 
 
 
294 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  38.95 
 
 
278 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
285 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  40.8 
 
 
285 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
324 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  39.69 
 
 
274 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
285 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
285 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
285 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
285 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  41.47 
 
 
286 aa  185  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  38.43 
 
 
278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1497  IclR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  41.06 
 
 
285 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
316 aa  182  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
298 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
298 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
298 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
316 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
316 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
316 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  40.87 
 
 
316 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  40.87 
 
 
316 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  40.87 
 
 
316 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  40.87 
 
 
316 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  39.16 
 
 
297 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  39.31 
 
 
310 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  39.31 
 
 
314 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  39.31 
 
 
314 aa  178  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  39.04 
 
 
318 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6032  IclR family transcriptional regulator  37.92 
 
 
279 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
268 aa  162  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3476  IclR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  32.91 
 
 
308 aa  125  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  29.25 
 
 
259 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5918  IclR family transcriptional regulator family  32.79 
 
 
298 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  30.8 
 
 
249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  25.81 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  29.15 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6800  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 
252 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  25.81 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0043  transcriptional regulator, IclR family  34.25 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  29.54 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5886  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  29.54 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  29.36 
 
 
254 aa  113  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  29.54 
 
 
250 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  28.98 
 
 
263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  28.98 
 
 
263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  29.11 
 
 
250 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  28.98 
 
 
263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  29.54 
 
 
250 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  30.35 
 
 
303 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
250 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  28.27 
 
 
250 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  28.27 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  28.27 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  27.85 
 
 
250 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  32.87 
 
 
264 aa  109  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4070  IclR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
274 aa  109  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  25.3 
 
 
251 aa  109  6e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
268 aa  108  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
260 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  33.61 
 
 
267 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  28.4 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  30.52 
 
 
265 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.38 
 
 
261 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6262  IclR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
260 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  29.75 
 
 
269 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  27.12 
 
 
262 aa  106  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  31.62 
 
 
267 aa  107  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
267 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  26.69 
 
 
276 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
275 aa  107  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3600  regulatory protein, IclR  28.12 
 
 
278 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633228  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  29.49 
 
 
254 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  26.69 
 
 
256 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
254 aa  106  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  30.31 
 
 
267 aa  105  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  23.79 
 
 
252 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1930  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
261 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>