More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3600 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3600  regulatory protein, IclR  100 
 
 		 278 aa  554  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633228  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0480  IclR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 278 aa  159  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 295 aa  155  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  38.31 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  35.79 
 
 		 275 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  35.79 
 
 		 275 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  32.36 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 318 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 310 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 314 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 285 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3965  IclR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 314 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 284 aa  115  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  29.73 
 
 		 261 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 284 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 284 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 284 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 284 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 284 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 284 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 284 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 316 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1497  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 316 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 316 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  32.24 
 
 		 324 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  28.06 
 
 		 256 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 268 aa  112  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6032  IclR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 279 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  32.44 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  32.79 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 324 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  32.39 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0134  IclR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 268 aa  106  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272177  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4432  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  27.6 
 
 		 254 aa  103  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  31.37 
 
 		 267 aa  102  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 267 aa  102  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 267 aa  102  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  33.46 
 
 		 253 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  27.89 
 
 		 257 aa  98.6  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  30.31 
 
 		 277 aa  96.7  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2380  IclR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 254 aa  96.3  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102909  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  30.12 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  31.37 
 
 		 267 aa  95.5  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  30.65 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  30.65 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  27.84 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  35.07 
 
 		 259 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  23.6 
 
 		 251 aa  94.4  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3476  IclR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  29.22 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  34.09 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 273 aa  93.2  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 319 aa  92.8  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 275 aa  92.4  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 261 aa  92.4  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 260 aa  92.4  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  28.19 
 
 		 260 aa  92.4  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3947  IclR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 267 aa  91.3  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  34.11 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 260 aa  90.5  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 269 aa  89.7  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 263 aa  89.4  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  27.57 
 
 		 260 aa  89  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  27.87 
 
 		 260 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 262 aa  87.8  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19700  transcriptional regulator, IclR family  31.28 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.089385  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  30.18 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  27.82 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>