More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0480 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0480  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 259 aa  511  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3600  regulatory protein, IclR  49.62 
 
 		 278 aa  217  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633228  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 276 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  34.6 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000240863  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 255 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 256 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  34.29 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 268 aa  96.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 254 aa  96.3  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  30.09 
 
 		 256 aa  95.5  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  32.78 
 
 		 275 aa  95.5  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  32.78 
 
 		 275 aa  95.5  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  27.69 
 
 		 252 aa  93.6  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  28.64 
 
 		 265 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 294 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 		 294 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 274 aa  92.4  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 284 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  32.79 
 
 		 291 aa  90.5  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 262 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  32.55 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1497  IclR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 284 aa  90.1  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  26.23 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0645  transcriptional regulator, IclR family  30.86 
 
 		 259 aa  89.7  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 285 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 286 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 316 aa  89.4  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  30.26 
 
 		 277 aa  89.4  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 268 aa  89.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 263 aa  89.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  25.42 
 
 		 260 aa  89  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 314 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 285 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 285 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 285 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 285 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  33.03 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 314 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  31.03 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  27.57 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  31.93 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  25.42 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 298 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 318 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 298 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  28.69 
 
 		 280 aa  86.7  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  31.03 
 
 		 268 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 310 aa  86.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 269 aa  86.3  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  32.57 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4860  IclR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 274 aa  86.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 285 aa  86.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 285 aa  85.9  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  26.24 
 
 		 260 aa  85.9  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 250 aa  85.5  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 272 aa  85.5  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  33.64 
 
 		 254 aa  85.5  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 270 aa  85.1  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 270 aa  85.1  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 270 aa  85.1  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 270 aa  85.1  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  29.73 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  30.38 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  29.24 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19700  transcriptional regulator, IclR family  33.95 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.089385  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>